34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK01000 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK01000  conserved hypothetical protein  100 
 
 
644 aa  1320    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0847196  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85359  predicted protein  40.53 
 
 
641 aa  305  2.0000000000000002e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0278738  normal  0.155514 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05407  GTPase activating protein (Evi5), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13850)  41.63 
 
 
872 aa  221  3.9999999999999997e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0970928 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01980  GTPase activating protein (Gyp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10600)  38.21 
 
 
883 aa  216  8e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0011064 
 
 
-
 
NC_006686  CND01110  conserved hypothetical protein  31.94 
 
 
1051 aa  146  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10479  predicted protein  37.44 
 
 
300 aa  143  9e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11010  GTPase activating protein (Gyp2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07440)  32.8 
 
 
1120 aa  130  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.988868 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01510  mic1-like protein, putative  34.36 
 
 
1053 aa  130  8.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86304  GTPase activating protein (GAP)  33.33 
 
 
938 aa  129  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04290  GTPase activating protein, putative  28.74 
 
 
647 aa  114  5e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10355  GTPase activating protein (Gyp3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12870)  26.72 
 
 
845 aa  106  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000127228  normal  0.582119 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00620  Rab GTPase activator, putative  30.04 
 
 
1137 aa  105  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_8298  predicted protein  37.96 
 
 
137 aa  100  9e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5426  predicted protein  31.56 
 
 
230 aa  99.8  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0224644  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00573  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11220)  26.64 
 
 
1076 aa  94.7  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.456943  normal  0.0468183 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03094  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12470)  28.8 
 
 
824 aa  89  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.467461  normal  0.746893 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82544  predicted protein  25.29 
 
 
558 aa  86.3  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85313  predicted protein  26.45 
 
 
658 aa  79.3  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.653403 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30439  predicted protein  29.52 
 
 
940 aa  68.9  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0509505 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00910  tbc1 domain family protein, putative  24.4 
 
 
598 aa  68.6  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03752  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04580)  27.15 
 
 
741 aa  67  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05780  hypothetical protein  24.59 
 
 
657 aa  63.9  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0217521  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00320  Rab GTPase activator, putative  22.28 
 
 
897 aa  61.6  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0237243  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16235  predicted protein  26.99 
 
 
440 aa  59.3  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31816  predicted protein  29.03 
 
 
554 aa  58.9  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0623295  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06618  GTPase activating protein (Gyp7), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03940)  19.31 
 
 
817 aa  54.3  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.472998 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84608  GTPase activating protein  20.51 
 
 
774 aa  52.4  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.323048 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2527  predicted protein  25.63 
 
 
333 aa  51.2  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.23532  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85276  predicted protein  21.38 
 
 
507 aa  50.4  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02160  conserved hypothetical protein  19.83 
 
 
860 aa  47.8  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45734  predicted protein  24.42 
 
 
602 aa  47.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28778  predicted protein  20.69 
 
 
318 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00481589  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12157  predicted protein  29.63 
 
 
330 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41673  predicted protein  25.15 
 
 
320 aa  44.3  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.455975  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>