20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_85276 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009047  PICST_85276  predicted protein  100 
 
 		 507 aa  1040    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00910  tbc1 domain family protein, putative  47.56 
 
 		 598 aa  333  4e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07444  GTPase activating protein (Gyp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06080)  50.16 
 
 		 523 aa  303  5.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000566047  normal  0.90636 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12157  predicted protein  45.78 
 
 		 330 aa  289  8e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2527  predicted protein  26.49 
 
 		 333 aa  112  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.23532  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00320  Rab GTPase activator, putative  23.94 
 
 		 897 aa  90.9  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0237243  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28778  predicted protein  24.07 
 
 		 318 aa  85.9  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00481589  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06618  GTPase activating protein (Gyp7), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03940)  23.93 
 
 		 817 aa  69.7  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.472998 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84608  GTPase activating protein  23.15 
 
 		 774 aa  68.9  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.323048 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00573  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11220)  23.91 
 
 		 1076 aa  67.4  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.456943  normal  0.0468183 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02160  conserved hypothetical protein  22.86 
 
 		 860 aa  63.9  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26794  predicted protein  25.99 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649939  normal  0.0260898 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05407  GTPase activating protein (Evi5), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13850)  23.05 
 
 		 872 aa  58.2  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0970928 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02790  expressed protein  28.33 
 
 		 393 aa  55.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5426  predicted protein  22.08 
 
 		 230 aa  54.7  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0224644  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04537  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02840)  24.12 
 
 		 684 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236302  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01000  conserved hypothetical protein  21.38 
 
 		 644 aa  51.2  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0847196  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16235  predicted protein  24.31 
 
 		 440 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01980  GTPase activating protein (Gyp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10600)  22.47 
 
 		 883 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0011064 
 
 
-
 
NC_006686  CND01110  conserved hypothetical protein  23.67 
 
 		 1051 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>