33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_85359 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_85359  predicted protein  100 
 
 
641 aa  1314    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0278738  normal  0.155514 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01000  conserved hypothetical protein  39.89 
 
 
644 aa  298  2e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0847196  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01980  GTPase activating protein (Gyp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10600)  37.6 
 
 
883 aa  248  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0011064 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05407  GTPase activating protein (Evi5), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13850)  36.09 
 
 
872 aa  200  6e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0970928 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10479  predicted protein  31.44 
 
 
300 aa  122  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01110  conserved hypothetical protein  28 
 
 
1051 aa  110  9.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11010  GTPase activating protein (Gyp2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07440)  26.22 
 
 
1120 aa  95.9  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.988868 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86304  GTPase activating protein (GAP)  28.7 
 
 
938 aa  94.7  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01510  mic1-like protein, putative  24 
 
 
1053 aa  85.9  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04290  GTPase activating protein, putative  25.1 
 
 
647 aa  84.7  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_8298  predicted protein  33.33 
 
 
137 aa  82.8  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82544  predicted protein  27.89 
 
 
558 aa  78.6  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03094  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12470)  27.27 
 
 
824 aa  77.8  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.467461  normal  0.746893 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00573  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11220)  27.56 
 
 
1076 aa  75.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.456943  normal  0.0468183 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10355  GTPase activating protein (Gyp3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12870)  19.93 
 
 
845 aa  69.3  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000127228  normal  0.582119 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00620  Rab GTPase activator, putative  23.89 
 
 
1137 aa  67.8  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5426  predicted protein  23.79 
 
 
230 aa  64.3  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0224644  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00320  Rab GTPase activator, putative  22.98 
 
 
897 aa  60.5  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0237243  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_25321  predicted protein  24.1 
 
 
515 aa  58.9  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.394545  normal  0.233867 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00910  tbc1 domain family protein, putative  19.48 
 
 
598 aa  58.2  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85313  predicted protein  21.86 
 
 
658 aa  58.2  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.653403 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06618  GTPase activating protein (Gyp7), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03940)  23.84 
 
 
817 aa  55.1  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.472998 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28778  predicted protein  23.79 
 
 
318 aa  54.7  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00481589  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30439  predicted protein  26.14 
 
 
940 aa  53.5  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0509505 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41673  predicted protein  25 
 
 
320 aa  52.8  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.455975  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00281  mitotic check point protein (Bub2), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02940)  28.87 
 
 
453 aa  50.8  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.558287  normal  0.0195499 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84608  GTPase activating protein  24.84 
 
 
774 aa  50.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.323048 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00740  mitotic check point protein bub2, putative  27.56 
 
 
286 aa  48.9  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48365  predicted protein  26.09 
 
 
751 aa  48.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31816  predicted protein  20.83 
 
 
554 aa  47.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0623295  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26794  predicted protein  21.36 
 
 
423 aa  46.2  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649939  normal  0.0260898 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04537  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02840)  24.24 
 
 
684 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236302  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_15898  predicted protein  23.08 
 
 
674 aa  44.7  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.062814  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>