24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_85313 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009047  PICST_85313  predicted protein  100 
 
 		 658 aa  1368    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.653403 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10355  GTPase activating protein (Gyp3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12870)  42.97 
 
 		 845 aa  317  6e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000127228  normal  0.582119 
 
 
-
 
NC_006686  CND01110  conserved hypothetical protein  34.14 
 
 		 1051 aa  146  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86304  GTPase activating protein (GAP)  28.69 
 
 		 938 aa  130  8.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10479  predicted protein  29.49 
 
 		 300 aa  129  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11010  GTPase activating protein (Gyp2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07440)  28.23 
 
 		 1120 aa  127  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.988868 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01510  mic1-like protein, putative  26.38 
 
 		 1053 aa  124  5e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5426  predicted protein  28.4 
 
 		 230 aa  112  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0224644  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00573  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11220)  29.44 
 
 		 1076 aa  99.8  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.456943  normal  0.0468183 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01000  conserved hypothetical protein  26.45 
 
 		 644 aa  92.4  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0847196  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30439  predicted protein  31.46 
 
 		 940 aa  93.2  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0509505 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05407  GTPase activating protein (Evi5), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13850)  27.67 
 
 		 872 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0970928 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00620  Rab GTPase activator, putative  25.48 
 
 		 1137 aa  80.5  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_15898  predicted protein  24.83 
 
 		 674 aa  77  0.0000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.062814  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04290  GTPase activating protein, putative  23.92 
 
 		 647 aa  73.6  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16235  predicted protein  27.04 
 
 		 440 aa  72  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_25081  predicted protein  24.63 
 
 		 802 aa  69.3  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.315559 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85359  predicted protein  21.86 
 
 		 641 aa  69.7  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0278738  normal  0.155514 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_8298  predicted protein  30.18 
 
 		 137 aa  67.8  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733722 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03094  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12470)  25.81 
 
 		 824 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.467461  normal  0.746893 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01980  GTPase activating protein (Gyp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10600)  25 
 
 		 883 aa  62.4  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0011064 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03752  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04580)  25 
 
 		 741 aa  56.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05780  hypothetical protein  21.6 
 
 		 657 aa  50.4  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0217521  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82544  predicted protein  28.8 
 
 		 558 aa  48.1  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>