250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_10260 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_10260  predicted protein  100 
 
 
465 aa  937    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.747034  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1397  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.52 
 
 
481 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2767  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  51.51 
 
 
465 aa  430  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0624  pyridine nucleotide transhydrogenase  50.64 
 
 
458 aa  426  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01571  pyridine nucleotide transhydrogenase  51.06 
 
 
462 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2041  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.06 
 
 
462 aa  423  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181904  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3066  pyridine nucleotide transhydrogenase  48.1 
 
 
494 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00270245  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1809  pyridine nucleotide transhydrogenase  51.06 
 
 
462 aa  423  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.391181  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3741  pyridine nucleotide transhydrogenase  50.21 
 
 
469 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2312  pyridine nucleotide transhydrogenase  51.06 
 
 
462 aa  423  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1788  pyridine nucleotide transhydrogenase  51.06 
 
 
462 aa  423  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01561  hypothetical protein  51.06 
 
 
462 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2028  pyridine nucleotide transhydrogenase  51.06 
 
 
462 aa  423  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1676  pyridine nucleotide transhydrogenase  51.06 
 
 
462 aa  423  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.544393  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3753  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  51.53 
 
 
471 aa  422  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.423097  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2841  pyridine nucleotide transhydrogenase  48.3 
 
 
494 aa  423  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1648  pyridine nucleotide transhydrogenase  50.21 
 
 
462 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250723  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1861  pyridine nucleotide transhydrogenase  50 
 
 
462 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.885026 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1694  pyridine nucleotide transhydrogenase  50.21 
 
 
462 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00431675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1597  pyridine nucleotide transhydrogenase  50.85 
 
 
462 aa  421  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.240547  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1580  pyridine nucleotide transhydrogenase  50.21 
 
 
462 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.339018  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7227  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  50.54 
 
 
470 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346916  normal  0.136469 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1757  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.26 
 
 
466 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284684  normal  0.879821 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1589  pyridine nucleotide transhydrogenase  50.21 
 
 
462 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250621  normal  0.984324 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0917  pyridine nucleotide transhydrogenase  48.1 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3418  pyridine nucleotide transhydrogenase  47.9 
 
 
494 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0951  pyridine nucleotide transhydrogenase  48.1 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0942  pyridine nucleotide transhydrogenase  48.1 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1850  pyridine nucleotide transhydrogenase  50.54 
 
 
462 aa  415  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.513378  normal  0.520422 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0498  pyridine nucleotide transhydrogenase  49.36 
 
 
458 aa  413  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000166801  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1652  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  50.11 
 
 
471 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000557684  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000127  NAD(P) transhydrogenase subunit beta  47.65 
 
 
458 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129759  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1942  pyridine nucleotide transhydrogenase  49.36 
 
 
464 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.530716  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2295  pyridine nucleotide transhydrogenase  49.36 
 
 
464 aa  413  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3082  pyridine nucleotide transhydrogenase  47.5 
 
 
494 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.167406  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0890  pyridine nucleotide transhydrogenase  47.5 
 
 
494 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0967297  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1831  pyridine nucleotide transhydrogenase  49.36 
 
 
464 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0853  pyridine nucleotide transhydrogenase  47.5 
 
 
494 aa  412  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  49.35 
 
 
482 aa  409  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2830  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.83 
 
 
466 aa  411  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07830  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  50 
 
 
472 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.368 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2107  pyridine nucleotide transhydrogenase  49.36 
 
 
462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05734  pyridine nucleotide transhydrogenase  47.46 
 
 
464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2079  pyridine nucleotide transhydrogenase  49.36 
 
 
457 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153868  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2584  pyridine nucleotide transhydrogenase  49.04 
 
 
464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0930  pyridine nucleotide transhydrogenase  47.5 
 
 
494 aa  403  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.339922  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0233  pyridine nucleotide transhydrogenase  46.37 
 
 
486 aa  402  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.448923  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3195  pyridine nucleotide transhydrogenase  46.91 
 
 
494 aa  405  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2400  pyridine nucleotide transhydrogenase  49.14 
 
 
462 aa  404  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228606  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4666  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  50.65 
 
 
465 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1862  pyridine nucleotide transhydrogenase  48.29 
 
 
462 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.534712  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5779  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  49.78 
 
 
470 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496694  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2120  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.96 
 
 
467 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228007  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  48.59 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2266  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.66 
 
 
462 aa  397  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340429  normal  0.366293 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5543  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  50 
 
 
470 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362184  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2173  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.97 
 
 
468 aa  396  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.04177  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0565  pyridine nucleotide transhydrogenase  48.06 
 
 
458 aa  395  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1784  pyridine nucleotide transhydrogenase  46.81 
 
 
469 aa  392  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2245  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.84 
 
 
468 aa  393  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0192  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.41 
 
 
473 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.483565  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0904  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.52 
 
 
463 aa  392  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278692  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1077  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.91 
 
 
480 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2278  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.4 
 
 
466 aa  386  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.314392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1815  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.27 
 
 
492 aa  386  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380425  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0090  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.75 
 
 
479 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.190826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0100  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.75 
 
 
479 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0548  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.53 
 
 
482 aa  379  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0109  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.75 
 
 
479 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1723  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.88 
 
 
491 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3899  NAD(P)+ transhydrogenase beta chain  44.15 
 
 
477 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0665157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2784  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.23 
 
 
472 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327338 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4267  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  43.38 
 
 
464 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4047  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.5 
 
 
479 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.754185  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0727  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  48.37 
 
 
479 aa  365  1e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0119  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.06 
 
 
479 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4703  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.4 
 
 
468 aa  362  8e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00565562  normal  0.677094 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0707  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.62 
 
 
477 aa  360  4e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.769172 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24220  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  46.09 
 
 
475 aa  359  7e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0239  pyridine nucleotide transhydrogenase beta subunit  44.74 
 
 
482 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.993412  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1882  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.74 
 
 
482 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1581  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.15 
 
 
482 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2491  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.89 
 
 
480 aa  356  5e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3428  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.9 
 
 
467 aa  354  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6856  pyridine nucleotide transhydrogenase (proton pump), beta subunit  45.45 
 
 
465 aa  352  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4660  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  43.63 
 
 
467 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226968  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2241  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  43.04 
 
 
468 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0680  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  43.1 
 
 
467 aa  348  1e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3202  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  42.21 
 
 
475 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.232806  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2894  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  41.87 
 
 
475 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.06 
 
 
484 aa  347  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2170  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  43.42 
 
 
486 aa  344  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3281  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  41.93 
 
 
502 aa  344  2e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0557  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.07 
 
 
466 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0972119  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4006  putative NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  41.41 
 
 
484 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161511  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3966  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.44 
 
 
466 aa  342  8e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155526  normal  0.614792 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1799  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.54 
 
 
455 aa  342  8e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.287028  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0907  NAD(P) transhydrogenase subunit beta (pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta)  43.66 
 
 
465 aa  341  1e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0634  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  43.43 
 
 
470 aa  342  1e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.282238  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1234  NAD(P)(+) transhydrogenase  42.04 
 
 
498 aa  341  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.035089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>