251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0853 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1850  pyridine nucleotide transhydrogenase  77.06 
 
 
462 aa  741    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.513378  normal  0.520422 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01571  pyridine nucleotide transhydrogenase  76.06 
 
 
462 aa  741    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2041  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  76.06 
 
 
462 aa  741    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181904  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1757  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  69.98 
 
 
466 aa  654    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284684  normal  0.879821 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1784  pyridine nucleotide transhydrogenase  71.6 
 
 
469 aa  687    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0498  pyridine nucleotide transhydrogenase  75.91 
 
 
458 aa  724    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000166801  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1788  pyridine nucleotide transhydrogenase  76.06 
 
 
462 aa  741    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850181  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3741  pyridine nucleotide transhydrogenase  93.52 
 
 
469 aa  915    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2079  pyridine nucleotide transhydrogenase  76.83 
 
 
457 aa  721    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153868  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1589  pyridine nucleotide transhydrogenase  77.06 
 
 
462 aa  741    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250621  normal  0.984324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1694  pyridine nucleotide transhydrogenase  77.06 
 
 
462 aa  741    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00431675  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2028  pyridine nucleotide transhydrogenase  76.06 
 
 
462 aa  741    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2295  pyridine nucleotide transhydrogenase  77.26 
 
 
464 aa  756    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2400  pyridine nucleotide transhydrogenase  78.07 
 
 
462 aa  727    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228606  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1597  pyridine nucleotide transhydrogenase  75.86 
 
 
462 aa  740    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.240547  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1580  pyridine nucleotide transhydrogenase  77.06 
 
 
462 aa  741    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.339018  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01561  hypothetical protein  76.06 
 
 
462 aa  741    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2312  pyridine nucleotide transhydrogenase  76.06 
 
 
462 aa  741    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1831  pyridine nucleotide transhydrogenase  77.26 
 
 
464 aa  756    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0942  pyridine nucleotide transhydrogenase  94.74 
 
 
494 aa  949    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3066  pyridine nucleotide transhydrogenase  94.74 
 
 
494 aa  949    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00270245  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3418  pyridine nucleotide transhydrogenase  94.53 
 
 
494 aa  947    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2107  pyridine nucleotide transhydrogenase  78.07 
 
 
462 aa  728    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1861  pyridine nucleotide transhydrogenase  76.86 
 
 
462 aa  740    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.885026 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000127  NAD(P) transhydrogenase subunit beta  74.29 
 
 
458 aa  723    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129759  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0624  pyridine nucleotide transhydrogenase  76.11 
 
 
458 aa  744    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1942  pyridine nucleotide transhydrogenase  77.26 
 
 
464 aa  756    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.530716  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0930  pyridine nucleotide transhydrogenase  82.79 
 
 
494 aa  829    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.339922  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1862  pyridine nucleotide transhydrogenase  77.26 
 
 
462 aa  700    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.534712  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0917  pyridine nucleotide transhydrogenase  94.74 
 
 
494 aa  949    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1809  pyridine nucleotide transhydrogenase  76.06 
 
 
462 aa  741    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.391181  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1648  pyridine nucleotide transhydrogenase  77.06 
 
 
462 aa  741    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250723  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0233  pyridine nucleotide transhydrogenase  76.32 
 
 
486 aa  732    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.448923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0951  pyridine nucleotide transhydrogenase  94.74 
 
 
494 aa  949    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3082  pyridine nucleotide transhydrogenase  100 
 
 
494 aa  988    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.167406  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0890  pyridine nucleotide transhydrogenase  100 
 
 
494 aa  988    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0967297  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05734  pyridine nucleotide transhydrogenase  74.49 
 
 
464 aa  722    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3195  pyridine nucleotide transhydrogenase  85.63 
 
 
494 aa  860    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0853  pyridine nucleotide transhydrogenase  100 
 
 
494 aa  988    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2584  pyridine nucleotide transhydrogenase  76.86 
 
 
464 aa  737    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2841  pyridine nucleotide transhydrogenase  88.06 
 
 
494 aa  886    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0565  pyridine nucleotide transhydrogenase  68.42 
 
 
458 aa  656    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2830  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  70.36 
 
 
466 aa  669    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1676  pyridine nucleotide transhydrogenase  76.06 
 
 
462 aa  741    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.544393  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0548  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  63.18 
 
 
482 aa  598  1e-170  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0192  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  62.85 
 
 
473 aa  599  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.483565  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2120  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  62.2 
 
 
467 aa  594  1e-169  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228007  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0904  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  63.35 
 
 
463 aa  593  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278692  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2173  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  63.43 
 
 
468 aa  593  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.04177  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1815  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  62.7 
 
 
492 aa  590  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380425  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  63.34 
 
 
471 aa  587  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1723  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  62.75 
 
 
491 aa  582  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07830  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  61.88 
 
 
472 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.368 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2266  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  61.57 
 
 
462 aa  584  1.0000000000000001e-165  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340429  normal  0.366293 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1397  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.12 
 
 
481 aa  578  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2767  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.44 
 
 
465 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2245  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  63.19 
 
 
468 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0090  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  64.74 
 
 
479 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.190826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0100  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  64.74 
 
 
479 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0109  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  64.74 
 
 
479 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.36 
 
 
482 aa  570  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7227  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.61 
 
 
470 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346916  normal  0.136469 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3753  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  60.24 
 
 
471 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.423097  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1652  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.84 
 
 
471 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000557684  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1077  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.93 
 
 
480 aa  556  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1882  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  62.7 
 
 
482 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0239  pyridine nucleotide transhydrogenase beta subunit  62.7 
 
 
482 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.993412  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1581  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  62.68 
 
 
482 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0119  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  65.26 
 
 
479 aa  548  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0707  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.92 
 
 
477 aa  546  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.769172 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5779  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.33 
 
 
470 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496694  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3899  NAD(P)+ transhydrogenase beta chain  61 
 
 
477 aa  548  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0665157  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4666  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.15 
 
 
465 aa  544  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2491  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  62.12 
 
 
480 aa  544  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0727  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  64.93 
 
 
479 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4047  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.06 
 
 
479 aa  538  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.754185  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2784  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  57.37 
 
 
472 aa  536  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327338 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5543  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  58.33 
 
 
470 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362184  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1234  NAD(P)(+) transhydrogenase  58.68 
 
 
498 aa  530  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.035089 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2278  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  57.8 
 
 
466 aa  521  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.314392 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3281  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  56.92 
 
 
502 aa  517  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24220  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  59 
 
 
475 aa  503  1e-141  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2181  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  52.71 
 
 
464 aa  474  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5464  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  50 
 
 
484 aa  458  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6856  pyridine nucleotide transhydrogenase (proton pump), beta subunit  51.09 
 
 
465 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4660  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.5 
 
 
467 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226968  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5018  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  49.02 
 
 
484 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4006  putative NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  48.94 
 
 
484 aa  448  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161511  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02470  pyridine nucleotide transhydrogenase, beta subunit  50.2 
 
 
478 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0545  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  50.2 
 
 
466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0895  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.58 
 
 
472 aa  445  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.479914  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0277  pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta  50.39 
 
 
478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0155  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.61 
 
 
478 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000848763 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3540  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  50 
 
 
465 aa  444  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261084  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0557  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  50 
 
 
466 aa  442  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0972119  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0173  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.61 
 
 
478 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69826  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2562  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.03 
 
 
486 aa  445  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0171  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.41 
 
 
478 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5072  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.4 
 
 
476 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235878  hitchhiker  0.00886969 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  48.53 
 
 
484 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>