28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_10187 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_10187  predicted protein  100 
 
 
171 aa  357  5e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37885  predicted protein  27.86 
 
 
365 aa  64.7  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51003  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44188  predicted protein  25.79 
 
 
347 aa  50.8  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  27.33 
 
 
247 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44404  predicted protein  25.53 
 
 
303 aa  47  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.262575  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.48 
 
 
277 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0316  Methyltransferase type 11  28.72 
 
 
96 aa  45.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
218 aa  45.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45667  predicted protein  27.62 
 
 
417 aa  45.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0157  hypothetical protein  27.4 
 
 
204 aa  44.7  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  25.47 
 
 
273 aa  44.3  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  23.53 
 
 
250 aa  44.3  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
243 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  32.47 
 
 
275 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11082  conserved hypothetical protein  27.33 
 
 
266 aa  42.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.788811  normal  0.50734 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.45 
 
 
246 aa  42.4  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4948  thiopurine S-methyltransferase  24.83 
 
 
206 aa  42.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527262  normal  0.560333 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1703  hypothetical protein  27.61 
 
 
234 aa  42.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  30.83 
 
 
268 aa  42  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  30.71 
 
 
233 aa  42  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1512  methyltransferase type 11  25.62 
 
 
190 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.358179  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.37 
 
 
239 aa  41.6  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3347  methyltransferase type 12  25.83 
 
 
201 aa  42  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.84561  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0120  Methyltransferase type 12  29.27 
 
 
209 aa  41.6  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  29.46 
 
 
312 aa  41.2  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  26.8 
 
 
195 aa  41.2  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  25.83 
 
 
250 aa  41.2  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1799  hypothetical protein  26.67 
 
 
201 aa  40.8  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.378794  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>