18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_25577 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_25577  predicted protein  100 
 
 
133 aa  273  7e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02260  ribosomal protein, putative  46.83 
 
 
139 aa  119  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9318  Ribosomal protein L14, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  44.96 
 
 
125 aa  110  5e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69792  predicted protein  44.53 
 
 
133 aa  107  8.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  unclonable  0.000000150395 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06629  ribosomal protein L14 (AFU_orthologue; AFUA_6G03830)  38.93 
 
 
218 aa  85.9  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0275138  normal  0.417921 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1127  50S ribosomal protein L14e  41.03 
 
 
103 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000887763 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0088  50S ribosomal protein L14e  39.74 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0079  50S ribosomal protein L14e  39.74 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.149247 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0053  50S ribosomal protein L14e  38.46 
 
 
103 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1371  50S ribosomal protein L14  38.96 
 
 
96 aa  60.5  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0158  ribosomal protein L14E  35.56 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.574976  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0055  50S ribosomal protein L14e  37.68 
 
 
96 aa  52.8  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.464279 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0462  50S ribosomal protein L14e  32 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1648  50S ribosomal protein L14e  37.5 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.481236  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1126  50S ribosomal protein L14e  39.06 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0980  50S ribosomal protein L14e  35.94 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0266  50S ribosomal protein L14e  35.94 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1498  50S ribosomal protein L14e  32.81 
 
 
77 aa  41.2  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>