18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0053 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0053  50S ribosomal protein L14e  100 
 
 		 103 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1127  50S ribosomal protein L14e  88.35 
 
 		 103 aa  179  9.000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000887763 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0079  50S ribosomal protein L14e  83.5 
 
 		 103 aa  176  1e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.149247 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0088  50S ribosomal protein L14e  83.5 
 
 		 103 aa  174  3e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0158  ribosomal protein L14E  64.95 
 
 		 104 aa  133  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.574976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0462  50S ribosomal protein L14e  67.03 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1371  50S ribosomal protein L14  65.56 
 
 		 96 aa  126  9.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0055  50S ribosomal protein L14e  63.74 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.464279 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1648  50S ribosomal protein L14e  56.96 
 
 		 77 aa  92.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.481236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1498  50S ribosomal protein L14e  55.7 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0266  50S ribosomal protein L14e  55.7 
 
 		 77 aa  90.9  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0980  50S ribosomal protein L14e  55.7 
 
 		 77 aa  90.5  8e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1126  50S ribosomal protein L14e  55.7 
 
 		 94 aa  88.6  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25577  predicted protein  38.46 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01166  60S ribosomal protein L6 (AFU_orthologue; AFUA_1G11130)  27.85 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0217  hypothetical protein  32.89 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.934654 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03060  structural constituent of ribosome, putative  31.67 
 
 		 235 aa  40.4  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34146  predicted protein  31.25 
 
 		 199 aa  40  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.465057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>