21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1371 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1371  50S ribosomal protein L14  100 
 
 
96 aa  190  6e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0055  50S ribosomal protein L14e  71.88 
 
 
96 aa  146  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.464279 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0462  50S ribosomal protein L14e  69.47 
 
 
98 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1127  50S ribosomal protein L14e  66.67 
 
 
103 aa  126  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000887763 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0088  50S ribosomal protein L14e  62.37 
 
 
103 aa  126  9.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0053  50S ribosomal protein L14e  65.56 
 
 
103 aa  126  9.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0079  50S ribosomal protein L14e  60 
 
 
103 aa  123  7e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.149247 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0158  ribosomal protein L14E  55.32 
 
 
104 aa  115  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.574976  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1648  50S ribosomal protein L14e  58.02 
 
 
77 aa  98.2  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.481236  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0980  50S ribosomal protein L14e  56.79 
 
 
77 aa  96.3  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0266  50S ribosomal protein L14e  56.79 
 
 
77 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1498  50S ribosomal protein L14e  55.56 
 
 
77 aa  94  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1126  50S ribosomal protein L14e  56.79 
 
 
94 aa  93.2  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25577  predicted protein  38.96 
 
 
133 aa  60.5  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01166  60S ribosomal protein L6 (AFU_orthologue; AFUA_1G11130)  36.07 
 
 
198 aa  45.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03060  structural constituent of ribosome, putative  32.26 
 
 
235 aa  43.9  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34146  predicted protein  34.92 
 
 
199 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.465057  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0217  hypothetical protein  29.41 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.934654 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36611  predicted protein  32.76 
 
 
176 aa  42  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.264026  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94758  Ribosomal protein L6, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  31.58 
 
 
169 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.027693  normal  0.201381 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02260  ribosomal protein, putative  32.94 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>