18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0088 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0088  50S ribosomal protein L14e  100 
 
 		 103 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1127  50S ribosomal protein L14e  88.35 
 
 		 103 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000887763 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0079  50S ribosomal protein L14e  84.47 
 
 		 103 aa  178  2e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.149247 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0053  50S ribosomal protein L14e  83.5 
 
 		 103 aa  174  3e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0158  ribosomal protein L14E  63.16 
 
 		 104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.574976  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1371  50S ribosomal protein L14  62.37 
 
 		 96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0462  50S ribosomal protein L14e  60.44 
 
 		 98 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0055  50S ribosomal protein L14e  59.34 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.464279 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1648  50S ribosomal protein L14e  55.7 
 
 		 77 aa  90.1  8e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.481236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1498  50S ribosomal protein L14e  54.43 
 
 		 77 aa  89.4  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0980  50S ribosomal protein L14e  54.43 
 
 		 77 aa  88.2  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0266  50S ribosomal protein L14e  54.43 
 
 		 77 aa  88.6  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1126  50S ribosomal protein L14e  54.43 
 
 		 94 aa  85.9  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25577  predicted protein  39.74 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01166  60S ribosomal protein L6 (AFU_orthologue; AFUA_1G11130)  30.38 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02260  ribosomal protein, putative  33.73 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03060  structural constituent of ribosome, putative  35 
 
 		 235 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34146  predicted protein  29.21 
 
 		 199 aa  40.8  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.465057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>