2450 genes were found for organism Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 25    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Bphy_3102  CDS  NC_010623  28  624  -  597  putative lipoprotein  YP_001859316  normal  0.0926165  normal  0.0477167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3103  CDS  NC_010623  737  1435  -  699  hypothetical protein  YP_001859317  normal  0.321838  normal  0.103631  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3104  CDS  NC_010623  1620  2570  +  951  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  YP_001859318  normal  0.0576219  normal  0.10828  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3105  CDS  NC_010623  2614  3207  -  594  hypothetical protein  YP_001859319  normal  0.04788  normal  0.13535  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3106  CDS  NC_010623  3387  3707  +  321  hypothetical protein  YP_001859320  normal  0.053259  normal  0.167409  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3107  CDS  NC_010623  3747  3965  +  219  FmdB family regulatory protein  YP_001859321  normal  0.04976  normal  0.162831  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3108  CDS  NC_010623  4050  4988  +  939  LysR family transcriptional regulator  YP_001859322  normal  0.12734  normal  0.186906  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3109  CDS  NC_010623  5093  6337  +  1245  major facilitator transporter  YP_001859323  normal  0.953505  normal  0.200859  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3110  CDS  NC_010623  6443  7117  -  675  two component transcriptional regulator  YP_001859324  normal  1  normal  0.178244  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3111  CDS  NC_010623  7319  8647  -  1329  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001859325  normal  1  normal  0.217081  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3112  CDS  NC_010623  8881  9189  -  309  hypothetical protein  YP_001859326  normal  1  normal  0.409121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3113  CDS  NC_010623  9287  9535  +  249  hypothetical protein  YP_001859327  normal  1  normal  0.404021  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3114  CDS  NC_010623  9590  9775  +  186  hypothetical protein  YP_001859328  normal  1  normal  0.386393  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3115  CDS  NC_010623  9835  10290  +  456  hypothetical protein  YP_001859329  normal  1  normal  0.409121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3116  CDS  NC_010623  10511  11461  +  951  taurine dioxygenase  YP_001859330  normal  1  normal  0.362427  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3117  CDS  NC_010623  11487  12611  -  1125  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  YP_001859331  normal  0.779943  normal  0.291751  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3118  CDS  NC_010623  12787  13785  -  999  hypothetical protein  YP_001859332  normal  0.358519  normal  0.367936  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3119  CDS  NC_010623  14272  14484  -  213  hypothetical protein  YP_001859333  normal  1  normal  0.824643  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3120  CDS  NC_010623  14658  15689  -  1032  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  YP_001859334  normal  1  normal  0.931687  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3121  CDS  NC_010623  15886  17373  -  1488  transcriptional regulator  YP_001859335  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3122  CDS  NC_010623  17578  17919  +  342  hypothetical protein  YP_001859336  normal  0.613531  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3123  CDS  NC_010623  17953  19107  -  1155  DNA-directed DNA polymerase  YP_001859337  normal  0.401966  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3124  CDS  NC_010623  19271  19576  -  306  hypothetical protein  YP_001859338  normal  0.0722858  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3125  CDS  NC_010623  19573  19791  -  219  hypothetical protein  YP_001859339  normal  0.0549965  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3126  CDS  NC_010623  20007  21191  -  1185  porin  YP_001859340  normal  0.0189644  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3127  CDS  NC_010623  21259  23700  -  2442  glycoside hydrolase family protein  YP_001859341  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3128  CDS  NC_010623  23724  25031  -  1308  major facilitator transporter  YP_001859342  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3129  CDS  NC_010623  25068  25403  +  336  hypothetical protein  YP_001859343  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3130  CDS  NC_010623  25871  26041  -  171  hypothetical protein  YP_001859344  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3131  CDS  NC_010623  26362  27120  +  759  putative glutathione S-transferase  YP_001859345  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3132  CDS  NC_010623  27262  27900  +  639  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_001859346  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3133  CDS  NC_010623  27908  28852  -  945  hypothetical protein  YP_001859347  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3134  CDS  NC_010623  28957  31275  -  2319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  YP_001859348  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3135  CDS  NC_010623  31367  32200  -  834  hypothetical protein  YP_001859349  normal  0.188851  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3136  CDS  NC_010623  32261  32932  -  672  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  YP_001859350  normal  0.0838279  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3137  CDS  NC_010623  33246  33458  +  213  hypothetical protein  YP_001859351  normal  0.0896468  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3138  CDS  NC_010623  33455  34933  +  1479  Na+/solute symporter  YP_001859352  normal  0.276907  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3139  CDS  NC_010623  35056  35787  -  732  precorrin-4 C11-methyltransferase  YP_001859353  normal  0.103399  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3140  CDS  NC_010623  35784  36521  -  738  cobalt-precorrin-6x reductase  YP_001859354  normal  0.167362  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3141  CDS  NC_010623  36518  37618  -  1101  cobalt-precorrin-6A synthase  YP_001859355  normal  0.303875  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3142  CDS  NC_010623  37618  38823  -  1206  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  YP_001859356  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3143  CDS  NC_010623  39178  40575  +  1398  precorrin-3B synthase  YP_001859357  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3144  CDS  NC_010623  40556  41194  +  639  precorrin-8X methylmutase  YP_001859358  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3145  CDS  NC_010623  41195  41950  +  756  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  YP_001859359  normal  0.34411  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3146  CDS  NC_010623  41947  43665  +  1719  precorrin-3B C17-methyltransferase  YP_001859360  normal  0.173567  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3147  CDS  NC_010623  43826  44779  +  954  type IV pilus assembly PilZ  YP_001859361  normal  0.16021  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3148  CDS  NC_010623  44904  46019  -  1116  OmpA/MotB domain-containing protein  YP_001859362  normal  0.597966  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3149  CDS  NC_010623  46071  54677  -  8607  hemagluttinin domain-containing protein  YP_001859363  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3150  CDS  NC_010623  55130  55777  -  648  magnesium chelatase subunit ChlD  YP_001859364  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3151  CDS  NC_010623  55807  56835  -  1029  magnesium chelatase  YP_001859365  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3152  CDS  NC_010623  56832  60635  -  3804  cobaltochelatase subunit CobN  YP_001859366  normal  0.456868  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3153  CDS  NC_010623  60646  61755  -  1110  cobalamin biosynthesis protein CobW  YP_001859367  normal  0.175243  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3154  CDS  NC_010623  62775  63518  +  744  uroporphyrin-III C-methyltransferase  YP_001859368  normal  0.345129  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3155  CDS  NC_010623  63515  63949  +  435  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  YP_001859369  normal  0.418613  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3156  CDS  NC_010623  63946  64548  +  603  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  YP_001859370  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3157  CDS  NC_010623  64552  65856  +  1305  glutamine amidotransferase  YP_001859371  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3158  CDS  NC_010623  65840  66535  +  696  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  YP_001859372  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3159  CDS  NC_010623  66565  67251  -  687  two component transcriptional regulator  YP_001859373  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3160  CDS  NC_010623  68114  69004  -  891  DeoR family transcriptional regulator  YP_001859374  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3161  CDS  NC_010623  69118  71601  +  2484  FAD dependent oxidoreductase  YP_001859375  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3162  CDS  NC_010623  71625  72482  -  858  AraC family transcriptional regulator  YP_001859376  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3163  CDS  NC_010623  72675  73556  +  882  NmrA family protein  YP_001859377  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3164    NC_010623  73689  74621  -  933      normal  0.489928  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3165  CDS  NC_010623  74700  75017  -  318  transposase IS3/IS911 family protein  YP_001859378  normal  0.897924  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3166    NC_010623  75130  75636  -  507      normal  0.877591  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3167  CDS  NC_010623  75755  76021  -  267  hypothetical protein  YP_001859379  normal  0.589085  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3168  CDS  NC_010623  76349  77254  -  906  chromosome replication initiation inhibitor protein  YP_001859380  normal  0.780444  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3169    NC_010623  77996  78463  -  468      normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3170    NC_010623  78617  78859  +  243      normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3171    NC_010623  79052  79513  +  462      normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3172  CDS  NC_010623  79549  80556  -  1008  quinone oxidoreductase  YP_001859381  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3173  CDS  NC_010623  80895  81908  +  1014  adenosine deaminase  YP_001859382  normal  0.523168  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3174  CDS  NC_010623  81901  83100  +  1200  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  YP_001859383  normal  0.898854  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3175  CDS  NC_010623  83465  84568  +  1104  NMT1/THI5-like domain-containing protein  YP_001859384  normal  0.311198  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3176  CDS  NC_010623  84670  85584  +  915  LysR family transcriptional regulator  YP_001859385  normal  0.594001  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3177    NC_010623  85619  87050  -  1432      normal  0.712412  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3178  CDS  NC_010623  87447  89603  +  2157  CoA-binding domain-containing protein  YP_001859386  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3179  CDS  NC_010623  89600  90427  +  828  enoyl-CoA hydratase/isomerase  YP_001859387  normal  0.608848  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3180  CDS  NC_010623  90473  91237  +  765  ABC transporter related  YP_001859388  normal  0.219824  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3181  CDS  NC_010623  91237  92070  +  834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001859389  normal  0.0283642  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3182  CDS  NC_010623  92112  92525  +  414  hypothetical protein  YP_001859390  normal  0.0231054  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3183  CDS  NC_010623  92538  93308  +  771  class II aldolase/adducin family protein  YP_001859391  normal  0.0280906  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3184  CDS  NC_010623  93305  94315  +  1011  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  YP_001859392  normal  0.179254  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3185  CDS  NC_010623  94397  95422  +  1026  adenosine deaminase  YP_001859393  normal  0.175868  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3186  CDS  NC_010623  95489  96628  -  1140  porin  YP_001859394  normal  0.501929  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3187  CDS  NC_010623  96892  97815  -  924  LysR family transcriptional regulator  YP_001859395  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3188  CDS  NC_010623  98076  99416  +  1341  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  YP_001859396  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3189  CDS  NC_010623  99416  99934  +  519  flavin reductase domain-containing protein  YP_001859397  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3190  CDS  NC_010623  100032  100238  +  207  hypothetical protein  YP_001859398  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3191  CDS  NC_010623  100235  101707  +  1473  Na+/solute symporter  YP_001859399  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3192    NC_010623  101766  102038  +  273      normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3193    NC_010623  102131  103338  -  1208      normal  0.583752  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3194  CDS  NC_010623  103536  104627  +  1092  ISRSO5-transposase protein  YP_001859400  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3195  CDS  NC_010623  104657  105730  -  1074  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_001859401  normal  0.0463138  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3196  CDS  NC_010623  105992  107077  -  1086  outer membrane protein (porin)  YP_001859402  decreased coverage  0.00143868  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3197  CDS  NC_010623  107221  108864  -  1644  glucose-methanol-choline oxidoreductase  YP_001859403  normal  0.0130434  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3198  CDS  NC_010623  108869  110365  -  1497  aldehyde dehydrogenase  YP_001859404  hitchhiker  0.00644996  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3199  CDS  NC_010623  110411  111595  -  1185  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  YP_001859405  normal  0.0555142  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3200  CDS  NC_010623  111656  112618  -  963  ferredoxin  YP_001859406  normal  0.22771  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3201  CDS  NC_010623  112803  114113  -  1311  phthalate 4,5-dioxygenase  YP_001859407  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 25    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>