19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3170 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3170    100 
 
 		 243 bp  482  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5655  tartrate dehydrogenase  86.88 
 
 		 1083 bp  208  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4654  tartrate dehydrogenase  83.57 
 
 		 1083 bp  141  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3709  tartrate dehydrogenase  83.57 
 
 		 1083 bp  141  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5024  tartrate dehydrogenase  82.72 
 
 		 1083 bp  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3812  tartrate dehydrogenase  82.13 
 
 		 1083 bp  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.402555  normal  0.309986 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5440  tartrate dehydrogenase  81.41 
 
 		 1083 bp  101  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3593  tartrate dehydrogenase  89.74 
 
 		 1083 bp  91.7  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1229  tartrate dehydrogenase  85.19 
 
 		 1095 bp  87.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3186  tartrate dehydrogenase  87.8 
 
 		 1089 bp  83.8  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5037  tartrate dehydrogenase  86.05 
 
 		 1131 bp  75.8  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.575355  normal  0.316837 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0996  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  86.96 
 
 		 1086 bp  65.9  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.932146  normal  0.0127706 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1027  tartrate dehydrogenase  88.33 
 
 		 1065 bp  63.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1620  tartrate dehydrogenase  86.67 
 
 		 1107 bp  56  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.607945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1016  tartrate dehydrogenase  88.24 
 
 		 1089 bp  54  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0586204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1445  tartrate dehydrogenase  87.76 
 
 		 1077 bp  50.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1432  tartrate dehydrogenase  87.76 
 
 		 1089 bp  50.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1120  tartrate dehydrogenase  86.27 
 
 		 1098 bp  46.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.656227  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1040  tartrate dehydrogenase  86.27 
 
 		 1098 bp  46.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>