118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3177 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3177    100 
 
 
1432 bp  2839    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.712412  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0489  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  81.27 
 
 
1437 bp  133  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0170  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.72 
 
 
1419 bp  119  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.525466  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.72 
 
 
1431 bp  119  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0093  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  80.71 
 
 
1425 bp  115  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3758  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  81.11 
 
 
1422 bp  115  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3286  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  81.12 
 
 
1434 bp  113  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.19663  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3656  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  89.11 
 
 
1425 bp  113  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  85.94 
 
 
1419 bp  111  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15851  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  85.38 
 
 
1416 bp  107  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.902922  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.32 
 
 
1419 bp  105  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0656  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  85.6 
 
 
1422 bp  105  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0735979 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0119  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  88.12 
 
 
1434 bp  105  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802054 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3333  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  85.16 
 
 
1425 bp  103  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2895  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  84.62 
 
 
1413 bp  99.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4683  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  87.76 
 
 
1440 bp  99.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  82.46 
 
 
1431 bp  97.6  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0652  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.27 
 
 
1461 bp  91.7  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0618  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.73 
 
 
1431 bp  91.7  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542253  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.96 
 
 
1422 bp  87.7  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0057  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.96 
 
 
1422 bp  87.7  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3417  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.96 
 
 
1422 bp  87.7  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1701  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.96 
 
 
1422 bp  87.7  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.96 
 
 
1422 bp  87.7  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.96 
 
 
1422 bp  87.7  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.96 
 
 
1422 bp  87.7  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0199  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.32 
 
 
1419 bp  85.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.868266  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0626  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  93.22 
 
 
1446 bp  85.7  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.549264  normal  0.0480596 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2519  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  83.76 
 
 
1545 bp  81.8  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3165  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.52 
 
 
1422 bp  81.8  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0178  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.52 
 
 
1422 bp  81.8  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0180  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.52 
 
 
1419 bp  81.8  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  81.25 
 
 
1413 bp  79.8  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  91.53 
 
 
1431 bp  77.8  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.640394  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0193  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  82.01 
 
 
1413 bp  77.8  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.551187  hitchhiker  0.00261817 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  85.26 
 
 
1419 bp  77.8  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7602  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  94.12 
 
 
1458 bp  77.8  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.588423 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0671  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  84.69 
 
 
1416 bp  75.8  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.130844  normal  0.0412083 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  87.84 
 
 
1419 bp  75.8  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0272  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  87.84 
 
 
1419 bp  75.8  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0254  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  87.84 
 
 
1419 bp  75.8  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2918  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  83.64 
 
 
1422 bp  75.8  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2392  adenosylhomocysteinase  82.79 
 
 
1413 bp  75.8  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.499407  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3375  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  85.39 
 
 
1419 bp  73.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  84.95 
 
 
1440 bp  73.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.901613 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0041  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  84.95 
 
 
1398 bp  73.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0210952  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2580  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  84.95 
 
 
1440 bp  73.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  82.03 
 
 
1437 bp  71.9  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  83.67 
 
 
1413 bp  67.9  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4286  adenosylhomocysteinase  92 
 
 
1488 bp  67.9  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285488  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4060  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  83.67 
 
 
1428 bp  67.9  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0475286  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3854  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  83.67 
 
 
1425 bp  67.9  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2526  adenosylhomocysteinase  93.33 
 
 
1497 bp  65.9  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127167  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  93.33 
 
 
1497 bp  65.9  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.892606  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1336  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  93.33 
 
 
1470 bp  65.9  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1198  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  93.33 
 
 
1479 bp  65.9  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.654496  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09210  adenosylhomocysteinase  93.33 
 
 
1521 bp  65.9  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.53378  normal  0.263004 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1354  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  93.33 
 
 
1470 bp  65.9  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.483366  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1372  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  93.33 
 
 
1470 bp  65.9  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.815282  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1192  adenosylhomocysteinase  93.33 
 
 
1467 bp  65.9  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3755  adenosylhomocysteinase  93.33 
 
 
1437 bp  65.9  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281872  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04338  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  83.87 
 
 
1443 bp  65.9  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1269  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  93.33 
 
 
1479 bp  65.9  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000838657 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05620  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  90.2 
 
 
1410 bp  61.9  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0532  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  90.2 
 
 
1398 bp  61.9  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4056  adenosylhomocysteinase  90.2 
 
 
1431 bp  61.9  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase (Eurofung)  90 
 
 
1896 bp  60  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0454669  normal  0.150578 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4976    90 
 
 
1394 bp  60  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.794685  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5068  adenosylhomocysteinase  90 
 
 
1410 bp  60  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.724438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0460  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  90 
 
 
1410 bp  60  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1589  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  87.93 
 
 
1416 bp  60  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  87.93 
 
 
1416 bp  60  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4849  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  90 
 
 
1410 bp  60  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0697439 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2301  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  82.35 
 
 
1422 bp  60  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0931  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  94.74 
 
 
1407 bp  60  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161754 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03570  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  90 
 
 
1398 bp  60  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0760213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2938  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  85.71 
 
 
1398 bp  60  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1875  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  82.18 
 
 
1428 bp  58  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  82.18 
 
 
1440 bp  58  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3444  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.15 
 
 
1404 bp  58  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.893839  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1675  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  82.18 
 
 
1293 bp  58  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4717  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  91.11 
 
 
1461 bp  58  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4075  adenosylhomocysteinase  86.15 
 
 
1539 bp  58  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal  0.0365971 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0468  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  81.03 
 
 
1431 bp  56  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.682945 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  87.5 
 
 
1395 bp  56  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1718  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  87.5 
 
 
1446 bp  56  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.415255  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2377  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.44 
 
 
1458 bp  54  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.913153  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0146  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  89.36 
 
 
1431 bp  54  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0449  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  88.24 
 
 
1410 bp  54  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0356  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.44 
 
 
1395 bp  54  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.31829  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1392  Adenosylhomocysteinase  88.24 
 
 
1428 bp  54  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  86.44 
 
 
1422 bp  54  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0763  adenosylhomocysteinase  88.24 
 
 
1428 bp  54  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401892  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  92.11 
 
 
1431 bp  52  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  88 
 
 
1398 bp  52  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168402  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17511  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  92.11 
 
 
1431 bp  52  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  90.48 
 
 
1392 bp  52  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0499  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  85.48 
 
 
1407 bp  52  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248655 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1346  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  84.29 
 
 
1398 bp  52  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1604  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  85.48 
 
 
1407 bp  52  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>