128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3112 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3112  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  201  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3630  hypothetical protein  52.81 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000854481  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0830  hypothetical protein  50.56 
 
 
109 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.308728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0489  hypothetical protein  46.3 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2375  hypothetical protein  48.6 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2625  hypothetical protein  48.86 
 
 
100 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269693  normal  0.125731 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4512  hypothetical protein  47.19 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874948  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2209  hypothetical protein  46.3 
 
 
105 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5354  hypothetical protein  45.26 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.679221 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5972  hypothetical protein  46.3 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4028  hypothetical protein  45.87 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5640  hypothetical protein  51.69 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232494  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2756  hypothetical protein  45.65 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4597  hypothetical protein  47.47 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5866  hypothetical protein  42.86 
 
 
122 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1255  hypothetical protein  46.07 
 
 
102 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154904  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3242  hypothetical protein  43.36 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.481595 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0686  hypothetical protein  39.22 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0982  hypothetical protein  39.22 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0855  hypothetical protein  39.22 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936199  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4734  hypothetical protein  47.13 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254908  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0495  hypothetical protein  39.22 
 
 
102 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2133  hypothetical protein  39.22 
 
 
102 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.198683  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3634  hypothetical protein  38.53 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4733  hypothetical protein  38.53 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.013159  normal  0.0161997 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1954  hypothetical protein  39.22 
 
 
102 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5549  hypothetical protein  38.53 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6178  hypothetical protein  45.78 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0765  hypothetical protein  38.24 
 
 
102 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1025  hypothetical protein  37.61 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0462952 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4973  hypothetical protein  43.97 
 
 
114 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.53439  normal  0.116031 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0901  hypothetical protein  48.48 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6203  hypothetical protein  40.57 
 
 
115 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4629  hypothetical protein  47.13 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1677  hypothetical protein  43.97 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674385 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0395  hypothetical protein  44.32 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820635  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4588  hypothetical protein  35.78 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0758849  hitchhiker  0.00165812 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1843  hypothetical protein  39.81 
 
 
103 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0711  hypothetical protein  50 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.438996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4935  hypothetical protein  40 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3225  hypothetical protein  40 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.855518 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4855  hypothetical protein  40.48 
 
 
83 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6636  hypothetical protein  44.32 
 
 
100 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.418268  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5402  hypothetical protein  40.48 
 
 
83 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.440332  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0827  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2514  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2375  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3274  hypothetical protein  39.29 
 
 
83 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0310372 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0421  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1799  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0470  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0632  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472438  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4458  hypothetical protein  44.57 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63243  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4124  hypothetical protein  36.7 
 
 
109 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00630342  normal  0.0204698 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3908  hypothetical protein  44.57 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3619  hypothetical protein  44.57 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1351  hypothetical protein  39.33 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0631212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2478  hypothetical protein  39.33 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4716  hypothetical protein  38.89 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110015  normal  0.0160912 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5531  hypothetical protein  43.53 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0335  hypothetical protein  39.33 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0613  hypothetical protein  39.33 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76614  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1289  hypothetical protein  39.33 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58939  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1217  hypothetical protein  39.33 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0956  hypothetical protein  39.33 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4675  hypothetical protein  44.57 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128716  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3286  hypothetical protein  43.48 
 
 
114 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4741  hypothetical protein  40.48 
 
 
83 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3802  hypothetical protein  43.48 
 
 
114 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6611  hypothetical protein  43.28 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5993  hypothetical protein  44.74 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227911  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5749  hypothetical protein  44.74 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518666  normal  0.911831 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1362  hypothetical protein  43.9 
 
 
99 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2180  hypothetical protein  40.38 
 
 
114 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0483956  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5841  hypothetical protein  43.28 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.516639  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6208  hypothetical protein  43.28 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00163451 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4159  hypothetical protein  41.75 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429697  normal  0.176279 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6684  hypothetical protein  43.28 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0468318  normal  0.226284 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0598  hypothetical protein  46.05 
 
 
172 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2330  hypothetical protein  46.05 
 
 
172 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2361  hypothetical protein  36.52 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.859635 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0871  hypothetical protein  47.37 
 
 
100 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1113  hypothetical protein  47.37 
 
 
100 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.281581  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1027  hypothetical protein  47.37 
 
 
100 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1838  hypothetical protein  47.37 
 
 
100 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.359362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1500  hypothetical protein  42.42 
 
 
101 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6329  hypothetical protein  42.42 
 
 
101 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366732  normal  0.8454 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6994  hypothetical protein  42.42 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0489051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3880  hypothetical protein  39.53 
 
 
99 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4489  hypothetical protein  39.53 
 
 
99 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5815  hypothetical protein  39.53 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.703977  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7213  hypothetical protein  36.7 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5082  hypothetical protein  52.17 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516272  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4557  hypothetical protein  52.17 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36871  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3942  hypothetical protein  36.7 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.859145 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0995  hypothetical protein  37.72 
 
 
115 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0293567  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4392  hypothetical protein  49.28 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0557  hypothetical protein  37.07 
 
 
117 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1036  hypothetical protein  37.07 
 
 
117 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4149  hypothetical protein  36.21 
 
 
117 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>