128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5402 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5402  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.440332  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4855  hypothetical protein  96.39 
 
 
83 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4741  hypothetical protein  86.75 
 
 
83 aa  144  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5531  hypothetical protein  86.75 
 
 
83 aa  143  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3274  hypothetical protein  78.31 
 
 
83 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0310372 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0127  hypothetical protein  63.53 
 
 
87 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4512  hypothetical protein  50.57 
 
 
108 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874948  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0830  hypothetical protein  50.57 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.308728 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6611  hypothetical protein  46.75 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2625  hypothetical protein  43.02 
 
 
100 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269693  normal  0.125731 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2375  hypothetical protein  43.53 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4935  hypothetical protein  45.78 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3225  hypothetical protein  45.78 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.855518 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0495  hypothetical protein  44 
 
 
102 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2133  hypothetical protein  44 
 
 
102 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.198683  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0489  hypothetical protein  54.55 
 
 
105 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0686  hypothetical protein  44 
 
 
116 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0982  hypothetical protein  44 
 
 
116 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0855  hypothetical protein  44 
 
 
116 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936199  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0765  hypothetical protein  44 
 
 
102 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1954  hypothetical protein  44 
 
 
102 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1843  hypothetical protein  44.74 
 
 
103 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2756  hypothetical protein  42.7 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4028  hypothetical protein  46.15 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3630  hypothetical protein  43.18 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000854481  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4597  hypothetical protein  47.06 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4629  hypothetical protein  44.74 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5841  hypothetical protein  47.76 
 
 
103 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.516639  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6208  hypothetical protein  47.76 
 
 
103 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00163451 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6684  hypothetical protein  47.76 
 
 
103 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0468318  normal  0.226284 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0711  hypothetical protein  50.59 
 
 
102 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.438996 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6636  hypothetical protein  45.35 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.418268  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5749  hypothetical protein  46.75 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518666  normal  0.911831 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5993  hypothetical protein  46.75 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227911  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1221  hypothetical protein  44.05 
 
 
109 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1700  hypothetical protein  44.05 
 
 
109 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3634  hypothetical protein  40.24 
 
 
109 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4733  hypothetical protein  40.24 
 
 
109 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.013159  normal  0.0161997 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5549  hypothetical protein  40.24 
 
 
109 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3772  hypothetical protein  48.91 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.685577  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4246  hypothetical protein  48.91 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0400746  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1500  hypothetical protein  45.45 
 
 
101 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6329  hypothetical protein  45.45 
 
 
101 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366732  normal  0.8454 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1025  hypothetical protein  39.02 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0462952 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0395  hypothetical protein  41.18 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820635  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1255  hypothetical protein  41.56 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154904  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5640  hypothetical protein  44.32 
 
 
103 aa  52  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232494  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3242  hypothetical protein  40.22 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.481595 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6994  hypothetical protein  45.45 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0489051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1657  hypothetical protein  48.35 
 
 
108 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0148111  normal  0.110028 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1673  hypothetical protein  44.83 
 
 
112 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.214967  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0901  hypothetical protein  46.97 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5866  hypothetical protein  39.47 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4392  hypothetical protein  50.67 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4588  hypothetical protein  38.27 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0758849  hitchhiker  0.00165812 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0421  hypothetical protein  48.53 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0827  hypothetical protein  48.53 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5354  hypothetical protein  36.36 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.679221 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5082  hypothetical protein  44.93 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516272  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1577  hypothetical protein  52.17 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.076498  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7213  hypothetical protein  46.15 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3286  hypothetical protein  42.7 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4557  hypothetical protein  44.93 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36871  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1799  hypothetical protein  48.53 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2514  hypothetical protein  48.53 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2375  hypothetical protein  48.53 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0470  hypothetical protein  48.53 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3802  hypothetical protein  42.7 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2209  hypothetical protein  47.5 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4004  hypothetical protein  45.65 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.719576  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4363  hypothetical protein  45.65 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.60678  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1351  hypothetical protein  33.7 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0631212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2478  hypothetical protein  33.7 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1516  hypothetical protein  38.04 
 
 
113 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293415  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0335  hypothetical protein  33.7 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0613  hypothetical protein  33.7 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76614  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1289  hypothetical protein  33.7 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58939  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1217  hypothetical protein  33.7 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0956  hypothetical protein  33.7 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5991  hypothetical protein  48.91 
 
 
109 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.982912  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0617  hypothetical protein  47.3 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6203  hypothetical protein  39.24 
 
 
115 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4124  hypothetical protein  39.51 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00630342  normal  0.0204698 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3494  hypothetical protein  47.76 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.274336  normal  0.475319 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2420  hypothetical protein  45 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.181326  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2180  hypothetical protein  42.7 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0483956  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0091  hypothetical protein  40.54 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0771  hypothetical protein  45 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216905  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1143  hypothetical protein  45 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1735  hypothetical protein  45 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1633  hypothetical protein  38.1 
 
 
108 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1218  hypothetical protein  45 
 
 
107 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000107745  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4458  hypothetical protein  41.11 
 
 
114 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63243  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3908  hypothetical protein  41.11 
 
 
114 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3619  hypothetical protein  41.11 
 
 
114 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0632  hypothetical protein  42.03 
 
 
110 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472438  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5099  hypothetical protein  47.92 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0579686  hitchhiker  0.00698414 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5972  hypothetical protein  45 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5329  hypothetical protein  42.86 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.638275  normal  0.0568115 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5161  hypothetical protein  49.06 
 
 
91 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0961668  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>