193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2375 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2375  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  254  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0489  hypothetical protein  56.31 
 
 
105 aa  103  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1500  hypothetical protein  53.85 
 
 
101 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6329  hypothetical protein  53.85 
 
 
101 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366732  normal  0.8454 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6994  hypothetical protein  51.92 
 
 
104 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0489051 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0830  hypothetical protein  57.78 
 
 
109 aa  98.2  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.308728 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4512  hypothetical protein  56.67 
 
 
108 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874948  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7213  hypothetical protein  52.58 
 
 
107 aa  98.2  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2756  hypothetical protein  61.05 
 
 
116 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3630  hypothetical protein  52.43 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000854481  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4028  hypothetical protein  51.89 
 
 
105 aa  94  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0395  hypothetical protein  45.22 
 
 
113 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820635  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5640  hypothetical protein  52.38 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232494  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5972  hypothetical protein  52.43 
 
 
105 aa  84  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4973  hypothetical protein  54.08 
 
 
114 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.53439  normal  0.116031 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2209  hypothetical protein  50.49 
 
 
105 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5354  hypothetical protein  50 
 
 
102 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.679221 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1255  hypothetical protein  47.62 
 
 
102 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154904  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1677  hypothetical protein  54.08 
 
 
114 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674385 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3242  hypothetical protein  52.73 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.481595 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0901  hypothetical protein  60.64 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0855  hypothetical protein  41.53 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936199  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4597  hypothetical protein  56.38 
 
 
116 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0982  hypothetical protein  41.53 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0686  hypothetical protein  41.53 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4629  hypothetical protein  52.75 
 
 
113 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0495  hypothetical protein  44.23 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2133  hypothetical protein  44.23 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.198683  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5099  hypothetical protein  60.27 
 
 
116 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0579686  hitchhiker  0.00698414 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4716  hypothetical protein  53.68 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110015  normal  0.0160912 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1954  hypothetical protein  44.23 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6203  hypothetical protein  51.58 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2625  hypothetical protein  50.55 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269693  normal  0.125731 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0765  hypothetical protein  43.27 
 
 
102 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4734  hypothetical protein  42.72 
 
 
100 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254908  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1843  hypothetical protein  56.06 
 
 
103 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5866  hypothetical protein  40.71 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0421  hypothetical protein  43.62 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0470  hypothetical protein  43.62 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1799  hypothetical protein  43.62 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0632  hypothetical protein  45.74 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472438  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0711  hypothetical protein  53.33 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.438996 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0827  hypothetical protein  42.55 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2514  hypothetical protein  42.55 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2375  hypothetical protein  42.55 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3274  hypothetical protein  42.7 
 
 
83 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0310372 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5549  hypothetical protein  40.37 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3634  hypothetical protein  40.37 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4733  hypothetical protein  40.37 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.013159  normal  0.0161997 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0091  hypothetical protein  47.83 
 
 
86 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6636  hypothetical protein  50.55 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.418268  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3918  hypothetical protein  41.94 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0617  hypothetical protein  46.94 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3112  hypothetical protein  48.6 
 
 
102 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5707  hypothetical protein  37.17 
 
 
113 aa  67  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6071  hypothetical protein  37.17 
 
 
113 aa  67  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.939472  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1144  hypothetical protein  46.15 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.461512  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6611  hypothetical protein  46.05 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1025  hypothetical protein  38.53 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0462952 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6555  hypothetical protein  36.28 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.831358  normal  0.817546 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5402  hypothetical protein  43.53 
 
 
83 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.440332  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3619  hypothetical protein  44.79 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4458  hypothetical protein  44.79 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63243  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3908  hypothetical protein  44.79 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6178  hypothetical protein  43.3 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6684  hypothetical protein  47.76 
 
 
103 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0468318  normal  0.226284 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5841  hypothetical protein  47.76 
 
 
103 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.516639  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3802  hypothetical protein  41.24 
 
 
114 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3286  hypothetical protein  41.24 
 
 
114 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4855  hypothetical protein  42.35 
 
 
83 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4588  hypothetical protein  48.48 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0758849  hitchhiker  0.00165812 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6208  hypothetical protein  47.76 
 
 
103 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00163451 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4675  hypothetical protein  42.27 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128716  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4392  hypothetical protein  60.56 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1494  hypothetical protein  41.49 
 
 
93 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4974  hypothetical protein  63.04 
 
 
100 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416203  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4454  hypothetical protein  63.04 
 
 
100 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6335  hypothetical protein  41.49 
 
 
93 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30067  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3494  hypothetical protein  45.65 
 
 
95 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.274336  normal  0.475319 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3593  hypothetical protein  45.78 
 
 
99 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.94814 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2180  hypothetical protein  43.01 
 
 
114 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0483956  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5082  hypothetical protein  48.57 
 
 
92 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516272  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1362  hypothetical protein  43.02 
 
 
99 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4557  hypothetical protein  48.57 
 
 
92 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36871  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2420  hypothetical protein  42.86 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.181326  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3321  hypothetical protein  44.58 
 
 
100 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5238  hypothetical protein  44.58 
 
 
100 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4741  hypothetical protein  41.57 
 
 
83 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5046  hypothetical protein  44.58 
 
 
100 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.395573  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5466  hypothetical protein  45.56 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.310164  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1735  hypothetical protein  42.86 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3880  hypothetical protein  40.7 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1143  hypothetical protein  42.86 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3924  hypothetical protein  41.86 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4159  hypothetical protein  44.34 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429697  normal  0.176279 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1218  hypothetical protein  42.86 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000107745  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4489  hypothetical protein  40.7 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5531  hypothetical protein  43.04 
 
 
83 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0771  hypothetical protein  42.86 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216905  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3206  hypothetical protein  39.05 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>