184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3286 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_3286  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  221  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3802  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  221  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4458  hypothetical protein  92.11 
 
 
114 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63243  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3908  hypothetical protein  92.11 
 
 
114 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3619  hypothetical protein  92.11 
 
 
114 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4675  hypothetical protein  90.35 
 
 
114 aa  176  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128716  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2180  hypothetical protein  87.72 
 
 
114 aa  170  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0483956  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0632  hypothetical protein  71.55 
 
 
110 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472438  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0827  hypothetical protein  69.83 
 
 
110 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2375  hypothetical protein  69.83 
 
 
110 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2514  hypothetical protein  69.83 
 
 
110 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0421  hypothetical protein  68.97 
 
 
110 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0470  hypothetical protein  68.97 
 
 
110 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1799  hypothetical protein  68.97 
 
 
110 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3630  hypothetical protein  50.5 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000854481  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1351  hypothetical protein  51.61 
 
 
113 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0631212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2478  hypothetical protein  51.61 
 
 
113 aa  84.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1217  hypothetical protein  51.61 
 
 
113 aa  84.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1289  hypothetical protein  51.61 
 
 
113 aa  84.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58939  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0956  hypothetical protein  51.61 
 
 
113 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0335  hypothetical protein  51.61 
 
 
113 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0613  hypothetical protein  51.61 
 
 
113 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76614  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4512  hypothetical protein  50.55 
 
 
108 aa  84  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874948  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1255  hypothetical protein  47.52 
 
 
102 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154904  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2209  hypothetical protein  51.58 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5549  hypothetical protein  57.32 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3634  hypothetical protein  57.32 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4733  hypothetical protein  57.32 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.013159  normal  0.0161997 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0489  hypothetical protein  53.12 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0830  hypothetical protein  47.32 
 
 
109 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.308728 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5972  hypothetical protein  53.26 
 
 
105 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1516  hypothetical protein  53.76 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293415  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5354  hypothetical protein  45.54 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.679221 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1025  hypothetical protein  54.88 
 
 
109 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0462952 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4588  hypothetical protein  46.36 
 
 
109 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0758849  hitchhiker  0.00165812 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0686  hypothetical protein  50.53 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0982  hypothetical protein  50.53 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0855  hypothetical protein  50.53 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936199  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0495  hypothetical protein  50.53 
 
 
102 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2133  hypothetical protein  50.53 
 
 
102 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.198683  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1954  hypothetical protein  50.53 
 
 
102 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2625  hypothetical protein  51.61 
 
 
100 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269693  normal  0.125731 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0765  hypothetical protein  49.47 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4734  hypothetical protein  45.83 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254908  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0617  hypothetical protein  53.61 
 
 
98 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5707  hypothetical protein  44 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4597  hypothetical protein  57.75 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6071  hypothetical protein  44 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.939472  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5640  hypothetical protein  49.02 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232494  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4935  hypothetical protein  52.86 
 
 
85 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4028  hypothetical protein  51.04 
 
 
105 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3225  hypothetical protein  52.86 
 
 
85 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.855518 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1843  hypothetical protein  51.22 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2375  hypothetical protein  41.24 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0395  hypothetical protein  46.24 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820635  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5238  hypothetical protein  55.84 
 
 
100 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3321  hypothetical protein  55.84 
 
 
100 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4124  hypothetical protein  50.55 
 
 
109 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00630342  normal  0.0204698 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5046  hypothetical protein  55.84 
 
 
100 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.395573  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4716  hypothetical protein  46.46 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110015  normal  0.0160912 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3242  hypothetical protein  57.73 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.481595 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6555  hypothetical protein  42 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.831358  normal  0.817546 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6636  hypothetical protein  52.69 
 
 
100 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.418268  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0995  hypothetical protein  52.04 
 
 
115 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0293567  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0557  hypothetical protein  51 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1036  hypothetical protein  51 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6178  hypothetical protein  50.7 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4149  hypothetical protein  51 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4668  hypothetical protein  43 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0901  hypothetical protein  55.88 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3593  hypothetical protein  55.13 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.94814 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4974  hypothetical protein  56 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416203  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4454  hypothetical protein  56 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6203  hypothetical protein  44.57 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2756  hypothetical protein  44.21 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2361  hypothetical protein  47.57 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.859635 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0711  hypothetical protein  48.04 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.438996 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0912  hypothetical protein  51 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0266951 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0900  hypothetical protein  51 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7213  hypothetical protein  43.75 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5466  hypothetical protein  62.5 
 
 
102 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.310164  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4159  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429697  normal  0.176279 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4629  hypothetical protein  47.89 
 
 
113 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1362  hypothetical protein  54.79 
 
 
99 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3772  hypothetical protein  51.49 
 
 
109 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.685577  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4246  hypothetical protein  51.49 
 
 
109 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0400746  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1144  hypothetical protein  60.71 
 
 
102 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.461512  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4392  hypothetical protein  63.64 
 
 
94 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4741  hypothetical protein  42.22 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5329  hypothetical protein  44.9 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.638275  normal  0.0568115 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3880  hypothetical protein  52.78 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3274  hypothetical protein  44.44 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0310372 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5866  hypothetical protein  40.21 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4489  hypothetical protein  52.78 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2420  hypothetical protein  42.35 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.181326  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6611  hypothetical protein  46.43 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5993  hypothetical protein  44.9 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227911  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1735  hypothetical protein  42.35 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5815  hypothetical protein  51.39 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.703977  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3494  hypothetical protein  46.15 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.274336  normal  0.475319 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>