188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4734 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4734  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  202  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254908  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5354  hypothetical protein  63.73 
 
 
102 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.679221 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1255  hypothetical protein  61.76 
 
 
102 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154904  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3630  hypothetical protein  57.84 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000854481  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4512  hypothetical protein  48.51 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874948  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5640  hypothetical protein  50.5 
 
 
103 aa  84.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232494  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0830  hypothetical protein  49.44 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.308728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0489  hypothetical protein  50.49 
 
 
105 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0711  hypothetical protein  55.45 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.438996 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0855  hypothetical protein  50.54 
 
 
116 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936199  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2625  hypothetical protein  41.67 
 
 
100 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269693  normal  0.125731 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0686  hypothetical protein  50.54 
 
 
116 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0982  hypothetical protein  50.54 
 
 
116 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0495  hypothetical protein  50.54 
 
 
102 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2133  hypothetical protein  50.54 
 
 
102 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.198683  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1954  hypothetical protein  50.54 
 
 
102 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0765  hypothetical protein  50.54 
 
 
102 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0395  hypothetical protein  41.44 
 
 
113 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820635  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2375  hypothetical protein  42.72 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2756  hypothetical protein  47.25 
 
 
116 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0901  hypothetical protein  52.63 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1843  hypothetical protein  53.25 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5549  hypothetical protein  47.83 
 
 
109 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3634  hypothetical protein  47.83 
 
 
109 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4629  hypothetical protein  46.59 
 
 
113 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4733  hypothetical protein  47.83 
 
 
109 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.013159  normal  0.0161997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1500  hypothetical protein  40.4 
 
 
101 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6329  hypothetical protein  40.4 
 
 
101 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366732  normal  0.8454 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4028  hypothetical protein  49.51 
 
 
105 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5866  hypothetical protein  47.13 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2209  hypothetical protein  52.43 
 
 
105 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6994  hypothetical protein  53.73 
 
 
104 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0489051 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4588  hypothetical protein  46.67 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0758849  hitchhiker  0.00165812 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4597  hypothetical protein  43.96 
 
 
116 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1025  hypothetical protein  46.74 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0462952 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5972  hypothetical protein  47.57 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0995  hypothetical protein  47.27 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0293567  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0557  hypothetical protein  46.43 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1036  hypothetical protein  46.43 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4458  hypothetical protein  44.79 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63243  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3908  hypothetical protein  44.79 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6203  hypothetical protein  47.19 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3619  hypothetical protein  44.79 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4149  hypothetical protein  46.43 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3802  hypothetical protein  45.83 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3286  hypothetical protein  45.83 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5118  hypothetical protein  51.43 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4675  hypothetical protein  44.33 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128716  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3918  hypothetical protein  38.46 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6636  hypothetical protein  40.62 
 
 
100 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.418268  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0900  hypothetical protein  45.54 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0912  hypothetical protein  45.54 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0266951 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6178  hypothetical protein  56.45 
 
 
104 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3494  hypothetical protein  52.24 
 
 
95 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.274336  normal  0.475319 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1677  hypothetical protein  48.51 
 
 
114 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674385 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4392  hypothetical protein  53.42 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4124  hypothetical protein  46.67 
 
 
109 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00630342  normal  0.0204698 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5161  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0961668  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0468  hypothetical protein  50 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2180  hypothetical protein  42.71 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0483956  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5099  hypothetical protein  47.76 
 
 
116 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0579686  hitchhiker  0.00698414 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3206  hypothetical protein  50 
 
 
103 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3242  hypothetical protein  51.43 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.481595 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4973  hypothetical protein  46.53 
 
 
114 aa  59.3  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.53439  normal  0.116031 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2361  hypothetical protein  52.24 
 
 
116 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.859635 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0617  hypothetical protein  53.25 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3593  hypothetical protein  49.37 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.94814 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1351  hypothetical protein  40.82 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0631212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0827  hypothetical protein  53.01 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2478  hypothetical protein  40.82 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1217  hypothetical protein  40.82 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2375  hypothetical protein  53.01 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0956  hypothetical protein  40.82 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1289  hypothetical protein  40.82 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58939  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2514  hypothetical protein  53.01 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0335  hypothetical protein  40.82 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0613  hypothetical protein  40.82 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76614  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0421  hypothetical protein  53.01 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7213  hypothetical protein  40 
 
 
107 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3274  hypothetical protein  41.38 
 
 
83 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0310372 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0470  hypothetical protein  53.01 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1799  hypothetical protein  53.01 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6611  hypothetical protein  46.84 
 
 
103 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5841  hypothetical protein  50 
 
 
103 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.516639  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6684  hypothetical protein  50 
 
 
103 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0468318  normal  0.226284 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5847  hypothetical protein  57.89 
 
 
202 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169933  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6208  hypothetical protein  50 
 
 
103 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00163451 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3607  hypothetical protein  51.52 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.668037 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5082  hypothetical protein  57.14 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516272  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1611  hypothetical protein  51.56 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4557  hypothetical protein  57.14 
 
 
92 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36871  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4332  hypothetical protein  59.26 
 
 
85 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.571244  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4935  hypothetical protein  44.83 
 
 
85 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3225  hypothetical protein  44.83 
 
 
85 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.855518 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5749  hypothetical protein  46.24 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518666  normal  0.911831 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4880  hypothetical protein  51.56 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000209692  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0632  hypothetical protein  50.6 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472438  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1027  hypothetical protein  46.24 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1838  hypothetical protein  46.24 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.359362  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1113  hypothetical protein  46.24 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.281581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>