207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1611 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_1611  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1634  hypothetical protein  95.37 
 
 
108 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1633  hypothetical protein  70.37 
 
 
108 aa  153  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4881  hypothetical protein  73.15 
 
 
109 aa  152  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000223725  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1610  hypothetical protein  70.37 
 
 
109 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4880  hypothetical protein  82.41 
 
 
108 aa  150  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000209692  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1221  hypothetical protein  69.44 
 
 
109 aa  147  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1700  hypothetical protein  69.44 
 
 
109 aa  147  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1673  hypothetical protein  69.37 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.214967  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1545  hypothetical protein  78.7 
 
 
104 aa  130  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.592635  normal  0.193226 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6430  hypothetical protein  62.04 
 
 
108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.382018 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4879  hypothetical protein  72.22 
 
 
109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00122865  normal  0.244901 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6143  hypothetical protein  59.26 
 
 
106 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0772787  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1674  hypothetical protein  71.3 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0939301  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1222  hypothetical protein  69.44 
 
 
108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0467648  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1701  hypothetical protein  70.37 
 
 
108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.973409  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1544  hypothetical protein  66.67 
 
 
109 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.199996 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1546  hypothetical protein  66.27 
 
 
110 aa  110  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.58247  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0617  hypothetical protein  51.14 
 
 
98 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5549  hypothetical protein  47.75 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3634  hypothetical protein  47.75 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4733  hypothetical protein  47.75 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.013159  normal  0.0161997 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2361  hypothetical protein  48.91 
 
 
116 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.859635 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3630  hypothetical protein  47.06 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000854481  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4512  hypothetical protein  51.04 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874948  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0489  hypothetical protein  49.41 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4028  hypothetical protein  51.76 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1025  hypothetical protein  45.95 
 
 
109 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0462952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5238  hypothetical protein  48.31 
 
 
100 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3321  hypothetical protein  48.31 
 
 
100 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5046  hypothetical protein  48.31 
 
 
100 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.395573  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0995  hypothetical protein  54.67 
 
 
115 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0293567  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4588  hypothetical protein  46.85 
 
 
109 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0758849  hitchhiker  0.00165812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1677  hypothetical protein  43.01 
 
 
114 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674385 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3924  hypothetical protein  51.69 
 
 
99 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3593  hypothetical protein  51.76 
 
 
99 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.94814 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1362  hypothetical protein  51.69 
 
 
99 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0855  hypothetical protein  47.75 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936199  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0982  hypothetical protein  47.75 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0686  hypothetical protein  47.75 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0632  hypothetical protein  49.43 
 
 
110 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472438  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4973  hypothetical protein  43.01 
 
 
114 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.53439  normal  0.116031 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5866  hypothetical protein  40.54 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0765  hypothetical protein  45.79 
 
 
102 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3242  hypothetical protein  50.57 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.481595 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0495  hypothetical protein  45.79 
 
 
102 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2133  hypothetical protein  45.79 
 
 
102 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.198683  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4388  hypothetical protein  51.69 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418441  normal  0.214663 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1954  hypothetical protein  45.79 
 
 
102 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4974  hypothetical protein  48.89 
 
 
100 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416203  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4124  hypothetical protein  51.14 
 
 
109 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00630342  normal  0.0204698 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4454  hypothetical protein  48.89 
 
 
100 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0827  hypothetical protein  49.43 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2514  hypothetical protein  49.43 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0557  hypothetical protein  53.25 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3880  hypothetical protein  50.56 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2375  hypothetical protein  49.43 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1036  hypothetical protein  53.25 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4489  hypothetical protein  50.56 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4149  hypothetical protein  47.31 
 
 
117 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0421  hypothetical protein  48.28 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0470  hypothetical protein  48.28 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5815  hypothetical protein  49.44 
 
 
99 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.703977  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1799  hypothetical protein  48.28 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4159  hypothetical protein  52.81 
 
 
100 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429697  normal  0.176279 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1255  hypothetical protein  45.28 
 
 
102 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154904  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0900  hypothetical protein  53.42 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0912  hypothetical protein  53.42 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0266951 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0830  hypothetical protein  49 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.308728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2756  hypothetical protein  43.36 
 
 
116 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1843  hypothetical protein  46.73 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5993  hypothetical protein  51.22 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227911  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5749  hypothetical protein  51.22 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518666  normal  0.911831 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5354  hypothetical protein  44.12 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.679221 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3942  hypothetical protein  51.09 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.859145 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0711  hypothetical protein  43.9 
 
 
102 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.438996 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5972  hypothetical protein  47.06 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0395  hypothetical protein  44.34 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820635  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2209  hypothetical protein  47.67 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4004  hypothetical protein  49.44 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.719576  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4363  hypothetical protein  49.44 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.60678  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5991  hypothetical protein  49.44 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.982912  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4392  hypothetical protein  65.91 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4716  hypothetical protein  40.7 
 
 
106 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110015  normal  0.0160912 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3201  hypothetical protein  37.38 
 
 
105 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1657  hypothetical protein  47.73 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0148111  normal  0.110028 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2453  hypothetical protein  39.45 
 
 
105 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2625  hypothetical protein  44.09 
 
 
100 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269693  normal  0.125731 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3772  hypothetical protein  48.31 
 
 
109 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.685577  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4246  hypothetical protein  48.31 
 
 
109 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0400746  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4734  hypothetical protein  44.09 
 
 
100 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254908  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5099  hypothetical protein  35.65 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0579686  hitchhiker  0.00698414 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1351  hypothetical protein  40.19 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0631212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2478  hypothetical protein  40.19 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0613  hypothetical protein  40.19 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76614  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4629  hypothetical protein  43.9 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4458  hypothetical protein  48.15 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63243  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0335  hypothetical protein  40.19 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3619  hypothetical protein  48.15 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3908  hypothetical protein  48.15 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>