139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3201 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_3201  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  215  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3086  hypothetical protein  92.38 
 
 
105 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00106547  hitchhiker  0.0088554 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6504  hypothetical protein  76.19 
 
 
103 aa  154  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3168  hypothetical protein  75.7 
 
 
105 aa  150  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0916362  hitchhiker  0.00000952165 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2535  hypothetical protein  75.7 
 
 
105 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.208912  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3148  hypothetical protein  75.7 
 
 
105 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.247723  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3142  hypothetical protein  63.81 
 
 
103 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000942368 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4881  hypothetical protein  38.18 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000223725  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1633  hypothetical protein  38.18 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1610  hypothetical protein  38.18 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1221  hypothetical protein  38.18 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1700  hypothetical protein  38.18 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1611  hypothetical protein  40.96 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1545  hypothetical protein  43.04 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.592635  normal  0.193226 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1362  hypothetical protein  46.91 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1673  hypothetical protein  39.82 
 
 
112 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.214967  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5354  hypothetical protein  37.35 
 
 
102 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.679221 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1544  hypothetical protein  42.17 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.199996 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1634  hypothetical protein  39.76 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3593  hypothetical protein  47.37 
 
 
99 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.94814 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0995  hypothetical protein  44.16 
 
 
115 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0293567  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4880  hypothetical protein  37.35 
 
 
108 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000209692  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1546  hypothetical protein  38.27 
 
 
110 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.58247  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0557  hypothetical protein  43.04 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1036  hypothetical protein  43.04 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6430  hypothetical protein  36 
 
 
108 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.382018 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0617  hypothetical protein  47.83 
 
 
98 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3880  hypothetical protein  46.91 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4489  hypothetical protein  46.91 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4149  hypothetical protein  41.77 
 
 
117 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4454  hypothetical protein  47.83 
 
 
100 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4974  hypothetical protein  47.83 
 
 
100 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416203  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1222  hypothetical protein  36.14 
 
 
108 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0467648  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1701  hypothetical protein  36.14 
 
 
108 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.973409  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0912  hypothetical protein  43.04 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0266951 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0102  hypothetical protein  41.43 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17256  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0830  hypothetical protein  37.36 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.308728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1255  hypothetical protein  34.74 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154904  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4388  hypothetical protein  42.31 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418441  normal  0.214663 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0900  hypothetical protein  43.04 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3924  hypothetical protein  42.31 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5815  hypothetical protein  45.68 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.703977  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4159  hypothetical protein  43.59 
 
 
100 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429697  normal  0.176279 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3630  hypothetical protein  34.41 
 
 
103 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000854481  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1674  hypothetical protein  34.94 
 
 
108 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0939301  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4879  hypothetical protein  34.15 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00122865  normal  0.244901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4332  hypothetical protein  38.16 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.571244  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3321  hypothetical protein  41.89 
 
 
100 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5238  hypothetical protein  41.89 
 
 
100 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5046  hypothetical protein  41.89 
 
 
100 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.395573  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4512  hypothetical protein  35.16 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874948  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6143  hypothetical protein  33.67 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0772787  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1843  hypothetical protein  42.68 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3004  hypothetical protein  39.44 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615381  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2361  hypothetical protein  39.24 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.859635 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5993  hypothetical protein  33.66 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227911  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1351  hypothetical protein  31.82 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0631212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2478  hypothetical protein  31.82 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3918  hypothetical protein  34.57 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0335  hypothetical protein  31.82 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0613  hypothetical protein  31.82 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76614  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5640  hypothetical protein  33.33 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232494  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1289  hypothetical protein  31.82 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58939  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1217  hypothetical protein  31.82 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0956  hypothetical protein  31.82 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4629  hypothetical protein  37.66 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5749  hypothetical protein  33.66 
 
 
103 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518666  normal  0.911831 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0686  hypothetical protein  39.58 
 
 
116 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0982  hypothetical protein  39.58 
 
 
116 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0855  hypothetical protein  39.58 
 
 
116 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936199  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0765  hypothetical protein  39.58 
 
 
102 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0495  hypothetical protein  39.58 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2133  hypothetical protein  39.58 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.198683  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1954  hypothetical protein  39.58 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0711  hypothetical protein  37.33 
 
 
102 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.438996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5013  hypothetical protein  40.74 
 
 
85 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805208  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1218  hypothetical protein  36.05 
 
 
107 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000107745  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2420  hypothetical protein  36.05 
 
 
112 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.181326  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0395  hypothetical protein  34.52 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820635  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6636  hypothetical protein  35.53 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.418268  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4215  hypothetical protein  39.47 
 
 
100 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0771  hypothetical protein  36.05 
 
 
107 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216905  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1143  hypothetical protein  36.05 
 
 
107 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1735  hypothetical protein  36.05 
 
 
107 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0468  hypothetical protein  40 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1025  hypothetical protein  37.65 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0462952 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5847  hypothetical protein  37.14 
 
 
202 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169933  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4588  hypothetical protein  33.68 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0758849  hitchhiker  0.00165812 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5329  hypothetical protein  35 
 
 
103 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.638275  normal  0.0568115 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5549  hypothetical protein  33.68 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4028  hypothetical protein  34.88 
 
 
105 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3634  hypothetical protein  33.68 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4733  hypothetical protein  33.68 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.013159  normal  0.0161997 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3206  hypothetical protein  37.65 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5082  hypothetical protein  37.31 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516272  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4557  hypothetical protein  37.31 
 
 
92 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36871  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3607  hypothetical protein  38.33 
 
 
99 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.668037 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5991  hypothetical protein  42.31 
 
 
109 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.982912  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3741  hypothetical protein  38.16 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.770461  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5161  hypothetical protein  37.63 
 
 
91 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0961668  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>