184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6430 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6430  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.382018 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6143  hypothetical protein  85.19 
 
 		 106 aa  184  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0772787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1610  hypothetical protein  64.81 
 
 		 109 aa  140  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1633  hypothetical protein  64.81 
 
 		 108 aa  140  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1221  hypothetical protein  61.11 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1700  hypothetical protein  61.11 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4881  hypothetical protein  60.19 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000223725  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1673  hypothetical protein  59.46 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.214967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4879  hypothetical protein  61.11 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00122865  normal  0.244901 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1634  hypothetical protein  62.04 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1611  hypothetical protein  62.04 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1546  hypothetical protein  56.63 
 
 		 110 aa  94.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.58247  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4880  hypothetical protein  54.63 
 
 		 108 aa  88.6  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000209692  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1674  hypothetical protein  56.48 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0939301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1222  hypothetical protein  54.63 
 
 		 108 aa  84.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0467648  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1701  hypothetical protein  55.56 
 
 		 108 aa  84.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.973409  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1544  hypothetical protein  54.55 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.199996 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1545  hypothetical protein  51.75 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.592635  normal  0.193226 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0557  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1036  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4149  hypothetical protein  48.72 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0995  hypothetical protein  51.32 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0293567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2361  hypothetical protein  48.72 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.859635 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3630  hypothetical protein  44.55 
 
 		 103 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000854481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0912  hypothetical protein  47.37 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0266951 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0900  hypothetical protein  47.37 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1255  hypothetical protein  48.61 
 
 		 102 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5866  hypothetical protein  47.06 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5815  hypothetical protein  44.44 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.703977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3880  hypothetical protein  44.44 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4512  hypothetical protein  53.62 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4489  hypothetical protein  44.44 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4388  hypothetical protein  44.94 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418441  normal  0.214663 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3924  hypothetical protein  44.21 
 
 		 99 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4028  hypothetical protein  43.02 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0489  hypothetical protein  40.66 
 
 		 105 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5993  hypothetical protein  43.9 
 
 		 103 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227911  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0830  hypothetical protein  42.11 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.308728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2756  hypothetical protein  38.26 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5749  hypothetical protein  42.05 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518666  normal  0.911831 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1025  hypothetical protein  38.66 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0462952 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4973  hypothetical protein  37.89 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.53439  normal  0.116031 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3321  hypothetical protein  42.86 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5238  hypothetical protein  42.86 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4159  hypothetical protein  43.16 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429697  normal  0.176279 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5046  hypothetical protein  42.86 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.395573  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0395  hypothetical protein  49.18 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4392  hypothetical protein  60.47 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0617  hypothetical protein  40.43 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5354  hypothetical protein  40 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.679221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3201  hypothetical protein  36 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5161  hypothetical protein  42.42 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0961668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0711  hypothetical protein  58.14 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.438996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3206  hypothetical protein  42.42 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5118  hypothetical protein  42.42 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3242  hypothetical protein  37.65 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.481595 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1362  hypothetical protein  42.11 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3494  hypothetical protein  38.1 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.274336  normal  0.475319 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1677  hypothetical protein  35.79 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674385 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2625  hypothetical protein  45.33 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269693  normal  0.125731 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3634  hypothetical protein  37.82 
 
 		 109 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5549  hypothetical protein  37.82 
 
 		 109 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3274  hypothetical protein  41.94 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0310372 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4733  hypothetical protein  37.82 
 
 		 109 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.013159  normal  0.0161997 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2209  hypothetical protein  42.86 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4557  hypothetical protein  46.67 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36871  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6504  hypothetical protein  31.48 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1843  hypothetical protein  48.68 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0686  hypothetical protein  49.33 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0982  hypothetical protein  49.33 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0855  hypothetical protein  49.33 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936199  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0495  hypothetical protein  49.33 
 
 		 102 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4629  hypothetical protein  37.88 
 
 		 113 aa  50.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2133  hypothetical protein  49.33 
 
 		 102 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.198683  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0765  hypothetical protein  49.33 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2453  hypothetical protein  45.16 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1954  hypothetical protein  49.33 
 
 		 102 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5082  hypothetical protein  42.19 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4734  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2535  hypothetical protein  38.55 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.208912  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4588  hypothetical protein  36.97 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0758849  hitchhiker  0.00165812 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3148  hypothetical protein  38.55 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.247723  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5972  hypothetical protein  40.66 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2420  hypothetical protein  52.94 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.181326  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5640  hypothetical protein  37.8 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0468  hypothetical protein  42.62 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4597  hypothetical protein  43.28 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4454  hypothetical protein  54.72 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4974  hypothetical protein  54.72 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1218  hypothetical protein  52.94 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000107745  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1143  hypothetical protein  52.94 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3168  hypothetical protein  37.35 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0916362  hitchhiker  0.00000952165 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1735  hypothetical protein  52.94 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0771  hypothetical protein  52.94 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216905  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3942  hypothetical protein  37.93 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.859145 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3593  hypothetical protein  52 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.94814 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6636  hypothetical protein  49.02 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.418268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1838  hypothetical protein  55 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.359362  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1027  hypothetical protein  55 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0871  hypothetical protein  55 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>