201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3924 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_3924  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  196  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4388  hypothetical protein  95.96 
 
 
99 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418441  normal  0.214663 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4159  hypothetical protein  83 
 
 
100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429697  normal  0.176279 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1362  hypothetical protein  83.84 
 
 
99 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0686  hypothetical protein  69.61 
 
 
116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0982  hypothetical protein  69.61 
 
 
116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0855  hypothetical protein  69.61 
 
 
116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936199  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0495  hypothetical protein  69.61 
 
 
102 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2133  hypothetical protein  69.61 
 
 
102 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.198683  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1954  hypothetical protein  69.61 
 
 
102 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0765  hypothetical protein  68.63 
 
 
102 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0617  hypothetical protein  75.76 
 
 
98 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5815  hypothetical protein  77.78 
 
 
99 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.703977  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3880  hypothetical protein  77.78 
 
 
99 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4489  hypothetical protein  77.78 
 
 
99 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3593  hypothetical protein  74.75 
 
 
99 aa  124  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.94814 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3321  hypothetical protein  75 
 
 
100 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5238  hypothetical protein  75 
 
 
100 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5046  hypothetical protein  75 
 
 
100 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.395573  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4974  hypothetical protein  77 
 
 
100 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416203  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4454  hypothetical protein  77 
 
 
100 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1843  hypothetical protein  66.02 
 
 
103 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6611  hypothetical protein  61.17 
 
 
103 aa  107  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5993  hypothetical protein  61.17 
 
 
103 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227911  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5749  hypothetical protein  61.17 
 
 
103 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518666  normal  0.911831 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5841  hypothetical protein  58.25 
 
 
103 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.516639  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6684  hypothetical protein  59.22 
 
 
103 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0468318  normal  0.226284 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6208  hypothetical protein  58.25 
 
 
103 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00163451 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5329  hypothetical protein  57.28 
 
 
103 aa  88.2  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.638275  normal  0.0568115 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0489  hypothetical protein  53.27 
 
 
105 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4028  hypothetical protein  53.27 
 
 
105 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5549  hypothetical protein  47.71 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3634  hypothetical protein  47.71 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4733  hypothetical protein  47.71 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.013159  normal  0.0161997 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5972  hypothetical protein  55.14 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4588  hypothetical protein  45.87 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0758849  hitchhiker  0.00165812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0830  hypothetical protein  52.48 
 
 
109 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.308728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2209  hypothetical protein  55.14 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1255  hypothetical protein  50.53 
 
 
102 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154904  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3630  hypothetical protein  53.85 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000854481  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4512  hypothetical protein  57.5 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874948  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1611  hypothetical protein  50.59 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1634  hypothetical protein  49.41 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1025  hypothetical protein  43.12 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0462952 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1545  hypothetical protein  53.09 
 
 
104 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.592635  normal  0.193226 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2375  hypothetical protein  42.45 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1677  hypothetical protein  46.96 
 
 
114 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674385 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3242  hypothetical protein  48.65 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.481595 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3942  hypothetical protein  49.54 
 
 
109 aa  72  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.859145 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0632  hypothetical protein  50 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472438  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1500  hypothetical protein  56.06 
 
 
101 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6329  hypothetical protein  56.06 
 
 
101 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366732  normal  0.8454 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6994  hypothetical protein  56.06 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0489051 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6555  hypothetical protein  39.13 
 
 
113 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.831358  normal  0.817546 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4880  hypothetical protein  48.24 
 
 
108 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000209692  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4124  hypothetical protein  46.79 
 
 
109 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00630342  normal  0.0204698 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0827  hypothetical protein  46.81 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2514  hypothetical protein  46.81 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4973  hypothetical protein  44.35 
 
 
114 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.53439  normal  0.116031 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5354  hypothetical protein  50.55 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.679221 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2375  hypothetical protein  46.81 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4716  hypothetical protein  44.86 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110015  normal  0.0160912 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0421  hypothetical protein  45.74 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0470  hypothetical protein  45.74 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1799  hypothetical protein  45.74 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5707  hypothetical protein  38.26 
 
 
113 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6071  hypothetical protein  38.26 
 
 
113 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.939472  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1633  hypothetical protein  43.64 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4668  hypothetical protein  40 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0995  hypothetical protein  48.25 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0293567  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3619  hypothetical protein  48.91 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2756  hypothetical protein  58.21 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4458  hypothetical protein  48.91 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63243  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1610  hypothetical protein  43.64 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3908  hypothetical protein  48.91 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4149  hypothetical protein  48.28 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4734  hypothetical protein  44.79 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254908  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0557  hypothetical protein  47.41 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1036  hypothetical protein  47.41 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1351  hypothetical protein  41.59 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0631212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2478  hypothetical protein  41.59 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0956  hypothetical protein  41.59 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1217  hypothetical protein  41.59 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0613  hypothetical protein  41.59 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76614  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0335  hypothetical protein  41.59 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1221  hypothetical protein  42.2 
 
 
109 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249228  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6143  hypothetical protein  43.69 
 
 
106 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0772787  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1289  hypothetical protein  41.59 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58939  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1700  hypothetical protein  42.2 
 
 
109 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1735  hypothetical protein  44.71 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2420  hypothetical protein  44.71 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.181326  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1657  hypothetical protein  48.62 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0148111  normal  0.110028 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0771  hypothetical protein  44.71 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216905  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1143  hypothetical protein  44.71 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4675  hypothetical protein  47.83 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128716  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5640  hypothetical protein  52.75 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232494  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1218  hypothetical protein  44.71 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000107745  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3802  hypothetical protein  47.83 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1673  hypothetical protein  39.47 
 
 
112 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.214967  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7213  hypothetical protein  50 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>