219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4028 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4028  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  205  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0489  hypothetical protein  90.48 
 
 
105 aa  168  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5972  hypothetical protein  72.38 
 
 
105 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0830  hypothetical protein  71.43 
 
 
109 aa  120  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.308728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2209  hypothetical protein  71.7 
 
 
105 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4512  hypothetical protein  70.33 
 
 
108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874948  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3630  hypothetical protein  67.74 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000854481  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2375  hypothetical protein  51.89 
 
 
125 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3242  hypothetical protein  66.06 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.481595 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0765  hypothetical protein  56.48 
 
 
102 aa  105  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0855  hypothetical protein  56.48 
 
 
116 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936199  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0686  hypothetical protein  56.48 
 
 
116 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0982  hypothetical protein  56.48 
 
 
116 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0495  hypothetical protein  56.48 
 
 
102 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2133  hypothetical protein  56.48 
 
 
102 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.198683  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5549  hypothetical protein  54.13 
 
 
109 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3634  hypothetical protein  54.13 
 
 
109 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1954  hypothetical protein  56.48 
 
 
102 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4733  hypothetical protein  54.13 
 
 
109 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.013159  normal  0.0161997 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5640  hypothetical protein  62.26 
 
 
103 aa  103  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232494  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5354  hypothetical protein  57.69 
 
 
102 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.679221 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2625  hypothetical protein  57.58 
 
 
100 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269693  normal  0.125731 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1843  hypothetical protein  56.48 
 
 
103 aa  100  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1025  hypothetical protein  51.38 
 
 
109 aa  98.6  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0462952 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1255  hypothetical protein  60.22 
 
 
102 aa  98.6  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154904  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4588  hypothetical protein  52.29 
 
 
109 aa  98.6  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0758849  hitchhiker  0.00165812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1677  hypothetical protein  64.91 
 
 
114 aa  98.2  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674385 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0395  hypothetical protein  53.57 
 
 
113 aa  97.1  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820635  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4973  hypothetical protein  63.16 
 
 
114 aa  94  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.53439  normal  0.116031 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0711  hypothetical protein  60.38 
 
 
102 aa  88.2  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.438996 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6636  hypothetical protein  60.61 
 
 
100 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.418268  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4124  hypothetical protein  53.21 
 
 
109 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00630342  normal  0.0204698 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4734  hypothetical protein  49.51 
 
 
100 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254908  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7213  hypothetical protein  50.93 
 
 
107 aa  86.7  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4629  hypothetical protein  51.61 
 
 
113 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2756  hypothetical protein  52.69 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3274  hypothetical protein  49.45 
 
 
83 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0310372 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6611  hypothetical protein  51.38 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4716  hypothetical protein  57.01 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110015  normal  0.0160912 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5866  hypothetical protein  43.64 
 
 
122 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5707  hypothetical protein  42.11 
 
 
113 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6071  hypothetical protein  42.11 
 
 
113 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.939472  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6555  hypothetical protein  42.11 
 
 
113 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.831358  normal  0.817546 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1351  hypothetical protein  46.49 
 
 
113 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0631212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2478  hypothetical protein  46.49 
 
 
113 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4880  hypothetical protein  54.32 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000209692  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4159  hypothetical protein  55.14 
 
 
100 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429697  normal  0.176279 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0613  hypothetical protein  46.49 
 
 
113 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76614  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1217  hypothetical protein  46.49 
 
 
113 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0956  hypothetical protein  46.49 
 
 
113 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1289  hypothetical protein  46.49 
 
 
113 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58939  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0335  hypothetical protein  46.49 
 
 
113 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5531  hypothetical protein  49.45 
 
 
83 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0632  hypothetical protein  60.64 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472438  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6329  hypothetical protein  56.06 
 
 
101 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366732  normal  0.8454 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1500  hypothetical protein  56.06 
 
 
101 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0617  hypothetical protein  54.29 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6203  hypothetical protein  50.54 
 
 
115 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6178  hypothetical protein  55.56 
 
 
104 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6994  hypothetical protein  56.06 
 
 
104 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0489051 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3942  hypothetical protein  53.21 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.859145 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3593  hypothetical protein  55.06 
 
 
99 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.94814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0901  hypothetical protein  54.95 
 
 
116 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3924  hypothetical protein  53.41 
 
 
99 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0421  hypothetical protein  57.45 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4597  hypothetical protein  54.32 
 
 
116 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4246  hypothetical protein  54.13 
 
 
109 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0400746  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6208  hypothetical protein  47.66 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00163451 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1799  hypothetical protein  57.45 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5841  hypothetical protein  47.66 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.516639  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3772  hypothetical protein  54.13 
 
 
109 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.685577  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0470  hypothetical protein  57.45 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4668  hypothetical protein  45.22 
 
 
113 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6684  hypothetical protein  47.66 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0468318  normal  0.226284 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0827  hypothetical protein  57.45 
 
 
110 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2375  hypothetical protein  57.45 
 
 
110 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2514  hypothetical protein  57.45 
 
 
110 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3918  hypothetical protein  38.79 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4741  hypothetical protein  48.35 
 
 
83 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1634  hypothetical protein  51.85 
 
 
108 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1362  hypothetical protein  56.82 
 
 
99 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5749  hypothetical protein  48.62 
 
 
103 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518666  normal  0.911831 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1611  hypothetical protein  53.09 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4392  hypothetical protein  82.09 
 
 
94 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4388  hypothetical protein  52.27 
 
 
99 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418441  normal  0.214663 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2420  hypothetical protein  53.93 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.181326  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1657  hypothetical protein  53.7 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0148111  normal  0.110028 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1735  hypothetical protein  53.93 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0771  hypothetical protein  53.93 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216905  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5402  hypothetical protein  46.15 
 
 
83 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.440332  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4855  hypothetical protein  46.15 
 
 
83 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1143  hypothetical protein  53.93 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5993  hypothetical protein  47.71 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227911  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0995  hypothetical protein  53.51 
 
 
115 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0293567  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1218  hypothetical protein  53.93 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000107745  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4149  hypothetical protein  53.45 
 
 
117 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5099  hypothetical protein  52.7 
 
 
116 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0579686  hitchhiker  0.00698414 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0557  hypothetical protein  52.59 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1036  hypothetical protein  52.59 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3880  hypothetical protein  52.87 
 
 
99 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>