136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4855 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4855  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  166  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5402  hypothetical protein  96.39 
 
 		 83 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.440332  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4741  hypothetical protein  87.95 
 
 		 83 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5531  hypothetical protein  87.95 
 
 		 83 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3274  hypothetical protein  79.52 
 
 		 83 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0310372 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4512  hypothetical protein  52.87 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0830  hypothetical protein  52.87 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.308728 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0127  hypothetical protein  62.35 
 
 		 87 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2625  hypothetical protein  46.51 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269693  normal  0.125731 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6611  hypothetical protein  48.05 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2375  hypothetical protein  42.35 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0495  hypothetical protein  45.33 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2133  hypothetical protein  45.33 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.198683  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0489  hypothetical protein  56.06 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4935  hypothetical protein  47.89 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3225  hypothetical protein  47.89 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.855518 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0686  hypothetical protein  45.33 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0982  hypothetical protein  45.33 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0855  hypothetical protein  45.33 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936199  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0765  hypothetical protein  45.33 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1954  hypothetical protein  45.33 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1843  hypothetical protein  46.05 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2756  hypothetical protein  44.32 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4629  hypothetical protein  46.05 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4028  hypothetical protein  46.15 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5841  hypothetical protein  49.25 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.516639  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6208  hypothetical protein  49.25 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00163451 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6684  hypothetical protein  49.25 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0468318  normal  0.226284 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0711  hypothetical protein  52.94 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.438996 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6636  hypothetical protein  46.51 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.418268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4597  hypothetical protein  47.06 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3630  hypothetical protein  42.31 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000854481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5993  hypothetical protein  46.75 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227911  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5749  hypothetical protein  46.75 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518666  normal  0.911831 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5549  hypothetical protein  41.46 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3634  hypothetical protein  41.46 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4733  hypothetical protein  41.46 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.013159  normal  0.0161997 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0395  hypothetical protein  42.35 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3772  hypothetical protein  48.91 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.685577  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4246  hypothetical protein  48.91 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0400746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5640  hypothetical protein  46.59 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1255  hypothetical protein  39.77 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3242  hypothetical protein  41.3 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.481595 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1025  hypothetical protein  40.24 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0462952 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0901  hypothetical protein  48.48 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1221  hypothetical protein  43.62 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249228  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1500  hypothetical protein  43.94 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4588  hypothetical protein  39.02 
 
 		 109 aa  52  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0758849  hitchhiker  0.00165812 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1700  hypothetical protein  43.62 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6329  hypothetical protein  43.94 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366732  normal  0.8454 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5354  hypothetical protein  38.64 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.679221 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1657  hypothetical protein  47.25 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0148111  normal  0.110028 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6994  hypothetical protein  43.94 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0489051 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5082  hypothetical protein  46.38 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0091  hypothetical protein  43.84 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4557  hypothetical protein  46.38 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36871  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4734  hypothetical protein  41.38 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7213  hypothetical protein  46.15 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2209  hypothetical protein  48.75 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4004  hypothetical protein  45.65 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.719576  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4363  hypothetical protein  45.65 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.60678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3286  hypothetical protein  41.57 
 
 		 114 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3802  hypothetical protein  41.57 
 
 		 114 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0421  hypothetical protein  48.53 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0827  hypothetical protein  48.53 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5991  hypothetical protein  48.91 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.982912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4392  hypothetical protein  49.33 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1799  hypothetical protein  48.53 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2514  hypothetical protein  48.53 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2375  hypothetical protein  48.53 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0470  hypothetical protein  48.53 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5118  hypothetical protein  44.44 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0617  hypothetical protein  48.65 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6203  hypothetical protein  40.51 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4124  hypothetical protein  40.24 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00630342  normal  0.0204698 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1577  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.076498  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5972  hypothetical protein  42.86 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3206  hypothetical protein  44.44 
 
 		 103 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5161  hypothetical protein  44.44 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0961668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3494  hypothetical protein  47.76 
 
 		 95 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.274336  normal  0.475319 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1351  hypothetical protein  32.61 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0631212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2478  hypothetical protein  32.61 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5866  hypothetical protein  36.84 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0335  hypothetical protein  32.61 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0613  hypothetical protein  32.61 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76614  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1289  hypothetical protein  32.61 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58939  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1217  hypothetical protein  32.61 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0956  hypothetical protein  32.61 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5099  hypothetical protein  52.17 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0579686  hitchhiker  0.00698414 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1673  hypothetical protein  41.49 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.214967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2420  hypothetical protein  41.18 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.181326  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1516  hypothetical protein  36.96 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293415  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0771  hypothetical protein  41.18 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216905  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1143  hypothetical protein  41.18 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1735  hypothetical protein  41.18 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5329  hypothetical protein  44.16 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.638275  normal  0.0568115 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2180  hypothetical protein  40.45 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0483956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1218  hypothetical protein  41.18 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000107745  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4458  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63243  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3908  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>