145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3918 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3918  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  228  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0830  hypothetical protein  39.36 
 
 
109 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.308728 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4512  hypothetical protein  37.62 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874948  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5354  hypothetical protein  39.62 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.679221 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3630  hypothetical protein  40.66 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000854481  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2375  hypothetical protein  41.94 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0489  hypothetical protein  40.87 
 
 
105 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5866  hypothetical protein  36.75 
 
 
122 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2625  hypothetical protein  38.95 
 
 
100 aa  67  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269693  normal  0.125731 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1255  hypothetical protein  41.76 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154904  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4734  hypothetical protein  38.46 
 
 
100 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254908  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0395  hypothetical protein  37.35 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820635  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4973  hypothetical protein  38.02 
 
 
114 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.53439  normal  0.116031 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4028  hypothetical protein  38.79 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0901  hypothetical protein  46.84 
 
 
116 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2756  hypothetical protein  39.81 
 
 
116 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1677  hypothetical protein  37.19 
 
 
114 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674385 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4629  hypothetical protein  39.77 
 
 
113 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5640  hypothetical protein  40.66 
 
 
103 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232494  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4597  hypothetical protein  41.05 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1351  hypothetical protein  40.62 
 
 
113 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0631212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2478  hypothetical protein  40.62 
 
 
113 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0335  hypothetical protein  40.62 
 
 
113 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0613  hypothetical protein  40.62 
 
 
113 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76614  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1289  hypothetical protein  40.62 
 
 
113 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58939  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1217  hypothetical protein  40.62 
 
 
113 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0956  hypothetical protein  40.62 
 
 
113 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5099  hypothetical protein  45.59 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0579686  hitchhiker  0.00698414 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1025  hypothetical protein  36.21 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0462952 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3634  hypothetical protein  35.34 
 
 
109 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4733  hypothetical protein  35.34 
 
 
109 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.013159  normal  0.0161997 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5549  hypothetical protein  35.34 
 
 
109 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6178  hypothetical protein  41.94 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3206  hypothetical protein  44.78 
 
 
103 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5161  hypothetical protein  44.78 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0961668  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5118  hypothetical protein  44.78 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5972  hypothetical protein  37.39 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7213  hypothetical protein  36.28 
 
 
107 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6203  hypothetical protein  36.63 
 
 
115 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3494  hypothetical protein  36.36 
 
 
95 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.274336  normal  0.475319 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6636  hypothetical protein  38.95 
 
 
100 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.418268  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0468  hypothetical protein  43.08 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4588  hypothetical protein  33.62 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0758849  hitchhiker  0.00165812 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6994  hypothetical protein  35.78 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0489051 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2209  hypothetical protein  35.96 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1500  hypothetical protein  42.86 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6329  hypothetical protein  42.86 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366732  normal  0.8454 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4716  hypothetical protein  36.84 
 
 
106 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110015  normal  0.0160912 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4935  hypothetical protein  36.78 
 
 
85 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3225  hypothetical protein  36.78 
 
 
85 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.855518 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3242  hypothetical protein  35.29 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.481595 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5082  hypothetical protein  43.64 
 
 
92 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516272  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4492  hypothetical protein  45.28 
 
 
106 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4557  hypothetical protein  43.64 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36871  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1516  hypothetical protein  47.17 
 
 
113 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293415  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0102  hypothetical protein  35.8 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17256  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1080  hypothetical protein  43.06 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258722  normal  0.0102105 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3286  hypothetical protein  49.09 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3802  hypothetical protein  49.09 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0598  hypothetical protein  37.66 
 
 
172 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2330  hypothetical protein  37.66 
 
 
172 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3201  hypothetical protein  34.57 
 
 
105 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0871  hypothetical protein  37.66 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1113  hypothetical protein  37.66 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.281581  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1027  hypothetical protein  37.66 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1838  hypothetical protein  37.66 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.359362  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0810  hypothetical protein  48.72 
 
 
109 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.298574 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0421  hypothetical protein  37.76 
 
 
110 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1799  hypothetical protein  37.76 
 
 
110 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0470  hypothetical protein  37.76 
 
 
110 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0827  hypothetical protein  37.76 
 
 
110 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2514  hypothetical protein  37.76 
 
 
110 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2375  hypothetical protein  37.76 
 
 
110 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3274  hypothetical protein  36.26 
 
 
83 aa  47.4  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0310372 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6611  hypothetical protein  33.93 
 
 
103 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1843  hypothetical protein  29.66 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4392  hypothetical protein  46.67 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0686  hypothetical protein  38.57 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3607  hypothetical protein  38.46 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.668037 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0982  hypothetical protein  38.57 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0855  hypothetical protein  38.57 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936199  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0495  hypothetical protein  38.57 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2133  hypothetical protein  38.57 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.198683  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6504  hypothetical protein  37.04 
 
 
103 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3880  hypothetical protein  35.48 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4215  hypothetical protein  35.44 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4489  hypothetical protein  35.48 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0765  hypothetical protein  38.57 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1954  hypothetical protein  38.57 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0711  hypothetical protein  36.92 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.438996 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5815  hypothetical protein  35.48 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.703977  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0632  hypothetical protein  36.73 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472438  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3741  hypothetical protein  35.44 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.770461  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5993  hypothetical protein  36.46 
 
 
103 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227911  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4124  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00630342  normal  0.0204698 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3142  hypothetical protein  37.5 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000942368 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1680  hypothetical protein  41.18 
 
 
100 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305616  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2180  hypothetical protein  45.45 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0483956  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3004  hypothetical protein  37.5 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615381  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1644  hypothetical protein  37.5 
 
 
203 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.653964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>