194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3741 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_3741  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  261  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.770461  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4215  hypothetical protein  95.06 
 
 
100 aa  158  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4284  hypothetical protein  81.01 
 
 
100 aa  134  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.271599 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4040  hypothetical protein  79.01 
 
 
100 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427751  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4326  hypothetical protein  79.01 
 
 
100 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3195  hypothetical protein  77.78 
 
 
100 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1680  hypothetical protein  79.01 
 
 
100 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305616  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0102  hypothetical protein  66.35 
 
 
118 aa  110  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5847  hypothetical protein  60.19 
 
 
202 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169933  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4332  hypothetical protein  63.86 
 
 
85 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.571244  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3004  hypothetical protein  63.75 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615381  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0598  hypothetical protein  59.48 
 
 
172 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2330  hypothetical protein  59.48 
 
 
172 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5013  hypothetical protein  64.86 
 
 
85 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805208  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1838  hypothetical protein  60 
 
 
100 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.359362  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1113  hypothetical protein  60 
 
 
100 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.281581  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0871  hypothetical protein  60 
 
 
100 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1027  hypothetical protein  60 
 
 
100 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1644  hypothetical protein  54.2 
 
 
203 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.653964  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0830  hypothetical protein  50 
 
 
109 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.308728 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4512  hypothetical protein  45.74 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874948  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2625  hypothetical protein  46.24 
 
 
100 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269693  normal  0.125731 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2756  hypothetical protein  48.91 
 
 
116 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0395  hypothetical protein  40.62 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820635  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3630  hypothetical protein  46.24 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000854481  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1677  hypothetical protein  46.6 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674385 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0632  hypothetical protein  48.45 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472438  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4597  hypothetical protein  47.25 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0827  hypothetical protein  49.46 
 
 
110 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2375  hypothetical protein  49.46 
 
 
110 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2514  hypothetical protein  49.46 
 
 
110 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3634  hypothetical protein  44.09 
 
 
109 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5549  hypothetical protein  44.09 
 
 
109 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4733  hypothetical protein  44.09 
 
 
109 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.013159  normal  0.0161997 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1351  hypothetical protein  44.68 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0631212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2478  hypothetical protein  44.68 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6555  hypothetical protein  42.57 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.831358  normal  0.817546 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1217  hypothetical protein  44.68 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5707  hypothetical protein  42.57 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0956  hypothetical protein  44.68 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1289  hypothetical protein  44.68 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58939  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6071  hypothetical protein  42.57 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.939472  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0335  hypothetical protein  44.68 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0613  hypothetical protein  44.68 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76614  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0421  hypothetical protein  48.39 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6203  hypothetical protein  44.44 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0470  hypothetical protein  48.39 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1799  hypothetical protein  48.39 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5972  hypothetical protein  51.61 
 
 
105 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6636  hypothetical protein  46.24 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.418268  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1025  hypothetical protein  41.94 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0462952 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0901  hypothetical protein  50 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4588  hypothetical protein  43.01 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0758849  hitchhiker  0.00165812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2209  hypothetical protein  49.46 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4629  hypothetical protein  43.3 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1255  hypothetical protein  44 
 
 
102 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154904  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3242  hypothetical protein  45.26 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.481595 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4973  hypothetical protein  43.69 
 
 
114 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.53439  normal  0.116031 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5354  hypothetical protein  41.18 
 
 
102 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.679221 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4935  hypothetical protein  45.78 
 
 
85 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3225  hypothetical protein  45.78 
 
 
85 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.855518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0489  hypothetical protein  47.31 
 
 
105 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4028  hypothetical protein  50.54 
 
 
105 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0273  hypothetical protein  49.21 
 
 
169 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5640  hypothetical protein  45.16 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232494  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4716  hypothetical protein  41.94 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110015  normal  0.0160912 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4734  hypothetical protein  43.01 
 
 
100 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254908  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3206  hypothetical protein  49.33 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1516  hypothetical protein  45.74 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293415  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0468  hypothetical protein  61.22 
 
 
92 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4668  hypothetical protein  38.61 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6178  hypothetical protein  49.33 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5161  hypothetical protein  61.22 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0961668  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5118  hypothetical protein  61.22 
 
 
91 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3741  hypothetical protein  56.52 
 
 
101 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5677  hypothetical protein  56.52 
 
 
101 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.780825 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0855  hypothetical protein  43.69 
 
 
116 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936199  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0982  hypothetical protein  43.69 
 
 
116 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4627  hypothetical protein  56.52 
 
 
101 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0686  hypothetical protein  43.69 
 
 
116 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4392  hypothetical protein  59.57 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3494  hypothetical protein  47.22 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.274336  normal  0.475319 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4246  hypothetical protein  47.31 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0400746  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3772  hypothetical protein  47.31 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.685577  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2375  hypothetical protein  35.11 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3607  hypothetical protein  50 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.668037 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4880  hypothetical protein  46.48 
 
 
108 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000209692  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5866  hypothetical protein  37.63 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5082  hypothetical protein  56.86 
 
 
92 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516272  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7213  hypothetical protein  40.91 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4557  hypothetical protein  56.86 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36871  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1843  hypothetical protein  46.99 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0495  hypothetical protein  44 
 
 
102 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2133  hypothetical protein  44 
 
 
102 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.198683  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0995  hypothetical protein  46.32 
 
 
115 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0293567  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0711  hypothetical protein  43.48 
 
 
102 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.438996 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0557  hypothetical protein  46.39 
 
 
117 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1954  hypothetical protein  44 
 
 
102 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4124  hypothetical protein  43.01 
 
 
109 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00630342  normal  0.0204698 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1036  hypothetical protein  46.39 
 
 
117 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>