148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4668 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4668  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  229  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6555  hypothetical protein  72.57 
 
 
113 aa  170  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.831358  normal  0.817546 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5707  hypothetical protein  69.91 
 
 
113 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6071  hypothetical protein  69.91 
 
 
113 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.939472  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2209  hypothetical protein  44.74 
 
 
105 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5972  hypothetical protein  42.98 
 
 
105 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4028  hypothetical protein  47.92 
 
 
105 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0489  hypothetical protein  43.48 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5549  hypothetical protein  38.98 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3634  hypothetical protein  38.98 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4733  hypothetical protein  38.98 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.013159  normal  0.0161997 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1351  hypothetical protein  42 
 
 
113 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0631212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2478  hypothetical protein  42 
 
 
113 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0335  hypothetical protein  42 
 
 
113 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0613  hypothetical protein  42 
 
 
113 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76614  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1289  hypothetical protein  42 
 
 
113 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58939  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1217  hypothetical protein  42 
 
 
113 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0956  hypothetical protein  42 
 
 
113 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4588  hypothetical protein  37.29 
 
 
109 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0758849  hitchhiker  0.00165812 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4716  hypothetical protein  43.9 
 
 
106 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110015  normal  0.0160912 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0830  hypothetical protein  45 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.308728 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1025  hypothetical protein  36.44 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0462952 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0421  hypothetical protein  42 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6611  hypothetical protein  38.79 
 
 
103 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4512  hypothetical protein  43 
 
 
108 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874948  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1799  hypothetical protein  42 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0470  hypothetical protein  42 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0827  hypothetical protein  42 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1516  hypothetical protein  45 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293415  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2514  hypothetical protein  42 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2375  hypothetical protein  42 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3924  hypothetical protein  40.7 
 
 
99 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0395  hypothetical protein  38.79 
 
 
113 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820635  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2375  hypothetical protein  35.4 
 
 
125 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3242  hypothetical protein  45.36 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.481595 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1677  hypothetical protein  41.67 
 
 
114 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674385 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0901  hypothetical protein  48.75 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0632  hypothetical protein  43 
 
 
110 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472438  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7213  hypothetical protein  46.15 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4246  hypothetical protein  38.46 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0400746  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3772  hypothetical protein  38.46 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.685577  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4388  hypothetical protein  39.58 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418441  normal  0.214663 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5815  hypothetical protein  40.7 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.703977  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5329  hypothetical protein  39.66 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.638275  normal  0.0568115 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3880  hypothetical protein  40.7 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4489  hypothetical protein  40.7 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4973  hypothetical protein  38.54 
 
 
114 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.53439  normal  0.116031 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1362  hypothetical protein  41.86 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3802  hypothetical protein  43 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3286  hypothetical protein  43 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4597  hypothetical protein  42.42 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2625  hypothetical protein  41.9 
 
 
100 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269693  normal  0.125731 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4458  hypothetical protein  44 
 
 
114 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63243  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3908  hypothetical protein  44 
 
 
114 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3619  hypothetical protein  44 
 
 
114 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4124  hypothetical protein  38.14 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00630342  normal  0.0204698 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3630  hypothetical protein  40 
 
 
103 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000854481  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1843  hypothetical protein  37.61 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5866  hypothetical protein  42.45 
 
 
122 aa  52  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5993  hypothetical protein  37.93 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227911  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0765  hypothetical protein  37.61 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4159  hypothetical protein  39.53 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429697  normal  0.176279 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0495  hypothetical protein  37.61 
 
 
102 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2133  hypothetical protein  37.61 
 
 
102 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.198683  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4004  hypothetical protein  44.68 
 
 
109 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.719576  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4363  hypothetical protein  44.68 
 
 
109 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.60678  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0686  hypothetical protein  37.61 
 
 
116 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0982  hypothetical protein  37.61 
 
 
116 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0855  hypothetical protein  37.61 
 
 
116 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1954  hypothetical protein  37.61 
 
 
102 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6684  hypothetical protein  36.84 
 
 
103 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0468318  normal  0.226284 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3942  hypothetical protein  37.93 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.859145 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5841  hypothetical protein  36.84 
 
 
103 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.516639  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6208  hypothetical protein  36.84 
 
 
103 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00163451 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4675  hypothetical protein  41.84 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128716  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5749  hypothetical protein  37.07 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518666  normal  0.911831 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1500  hypothetical protein  43.94 
 
 
101 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1611  hypothetical protein  43.68 
 
 
108 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6178  hypothetical protein  45.16 
 
 
104 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6329  hypothetical protein  43.94 
 
 
101 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366732  normal  0.8454 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5991  hypothetical protein  42.55 
 
 
109 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.982912  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0617  hypothetical protein  38.95 
 
 
98 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6994  hypothetical protein  42.42 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0489051 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1634  hypothetical protein  44.19 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2180  hypothetical protein  41 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0483956  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1221  hypothetical protein  44.83 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1700  hypothetical protein  44.83 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4880  hypothetical protein  41.38 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000209692  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4881  hypothetical protein  37.7 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000223725  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5238  hypothetical protein  37.5 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3321  hypothetical protein  37.5 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5046  hypothetical protein  37.5 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.395573  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2756  hypothetical protein  38.24 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4629  hypothetical protein  44.78 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3593  hypothetical protein  36.84 
 
 
99 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.94814 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5354  hypothetical protein  38 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.679221 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1633  hypothetical protein  44.83 
 
 
108 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4215  hypothetical protein  40.96 
 
 
100 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1610  hypothetical protein  35.9 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1546  hypothetical protein  41.38 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.58247  normal  0.185103 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>