283 genes were found for organism Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Rmet_5942  CDS  NC_007971  118607  119440  -  834  type II general secretion pathway ATPase  YP_581751  hitchhiker  0.00622047  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5943  CDS  NC_007971  118338  118553  -  216  hypothetical protein  YP_581752  normal  0.173026  normal  0.986624  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5944    NC_007971  117258  118196  +  939      normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5945  CDS  NC_007971  115142  117070  +  1929  Pb(II)-uptake protein PbrT  YP_581754  normal  1  normal  0.925731  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5946  CDS  NC_007971  114583  115020  +  438  MerR family transcriptional regulator PbrR  YP_581755  normal  1  normal  0.543608  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5947  CDS  NC_007971  112097  114496  -  2400  Pb(II) resistance ATPase PbrA  YP_581756  normal  1  normal  0.341676  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5948  CDS  NC_007971  111024  112100  -  1077  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  YP_581757  normal  1  normal  0.418988  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5949  CDS  NC_007971  109987  110856  -  870  Pb(II) resistance PbrD  YP_581758  normal  0.251908  normal  0.249852  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5950    NC_007971  109468  109881  +  414      normal  0.113108  normal  0.135346  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5951    NC_007971  107324  109240  -  1917      normal  1  normal  0.186103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5952    NC_007971  106300  107298  -  999      normal  1  normal  0.0920701  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5953    NC_007971  105880  106143  +  264      normal  1  normal  0.0809179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5954  CDS  NC_007971  104785  105795  -  1011  transposase ISRme10  YP_581763  normal  1  normal  0.0246651  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5955    NC_007971  104610  104714  +  105      normal  1  normal  0.0207427  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5956    NC_007971  104416  104562  +  147      normal  1  normal  0.0201554  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5957    NC_007971  103180  104361  +  1182      normal  1  normal  0.0111305  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5958    NC_007971  102799  103014  +  216      normal  1  hitchhiker  0.00874292  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5959    NC_007971  101871  102392  +  522      normal  1  normal  0.0200379  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5960    NC_007971  101354  101728  +  375      normal  1  normal  0.0196956  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5961    NC_007971  100167  100400  -  234      normal  1  hitchhiker  0.00913301  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5962  CDS  NC_007971  98192  99877  +  1686  family 39 glycosyltransferase  YP_581771  normal  1  decreased coverage  0.00513205  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5963  CDS  NC_007971  97227  97472  +  246  hypothetical protein  YP_581772  normal  1  hitchhiker  0.00896161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5964    NC_007971  96790  97116  -  327      normal  1  hitchhiker  0.00913301  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5965    NC_007971  96294  96572  +  279      normal  1  hitchhiker  0.00853064  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5966  CDS  NC_007971  94185  95792  -  1608  glycosyltransferase  YP_581775  normal  1  normal  0.0131214  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5967  CDS  NC_007971  93805  94188  -  384  bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA  YP_581776  normal  0.360184  normal  0.019808  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5968  CDS  NC_007971  92687  93808  -  1122  glycosyltransferase  YP_581777  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5969  CDS  NC_007971  92152  92454  -  303  hypothetical protein  YP_581778  decreased coverage  0.00195421  normal  0.0187189  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5970  CDS  NC_007971  89605  92094  +  2490  cation efflux ATPase CzcP  YP_581779  normal  0.0427741  normal  0.0148947  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5971  CDS  NC_007971  88683  89105  +  423  flagellar basal-body rod protein FlgB  YP_581780  normal  0.201131  normal  0.0194756  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5972  CDS  NC_007971  88102  88398  -  297  transposase DNA binding site ISRme3  YP_581781  normal  0.263153  normal  0.0380102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5973  CDS  NC_007971  87212  88105  -  894  transposase catalytic site ISRme3  YP_581782  normal  0.291095  normal  0.0449823  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5974  CDS  NC_007971  86028  87095  -  1068  porin OmpC  YP_581783  normal  0.0182107  normal  0.0474626  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5975  CDS  NC_007971  85567  85845  -  279  heavy metal resistance protein CzcJ  YP_581784  hitchhiker  0.00225387  normal  0.0705855  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5976  CDS  NC_007971  84867  85268  +  402  heavy metal resistance protein CzcE  YP_581785  hitchhiker  0.00188762  normal  0.0685611  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5977  CDS  NC_007971  83328  84758  +  1431  sensor histidine kinase  YP_581786  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5978  CDS  NC_007971  82646  83323  +  678  regulatory protein CzcR  YP_581787  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5979  CDS  NC_007971  81694  82644  +  951  cation diffusion facilitator CzcD  YP_581788  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5980  CDS  NC_007971  78452  81643  +  3192  heavy metal resistance protein CzcA  YP_581789  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5981  CDS  NC_007971  76873  78435  +  1563  cation proton antiporter efflux protein CzcB  YP_581790  decreased coverage  0.00000176523  normal  0.0829956  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5982  CDS  NC_007971  75599  76855  +  1257  cation proton antiporter efflux protein CzcC  YP_581791  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5983  CDS  NC_007971  75176  75523  +  348  cation efflux system protein CzcI  YP_581792  hitchhiker  0.000000294798  normal  0.0645657  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5984  CDS  NC_007971  74040  74861  +  822  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase CzcN  YP_581793  hitchhiker  0.0000000131174  normal  0.0380102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5985  CDS  NC_007971  73502  73960  -  459  Mg(II) transport ATPase  YP_581794  hitchhiker  0.000000520762  normal  0.0326186  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5986    NC_007971  72608  72898  +  291      hitchhiker  0.000159554  normal  0.112845  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5987  CDS  NC_007971  71183  72121  -  939  negative regulation of plasmid gene expression transcriptional repressor activity  YP_581796  normal  0.047679  normal  0.0804995  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5988  CDS  NC_007971  69699  71186  -  1488  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  YP_581797  normal  0.239926  normal  0.0876373  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5989  CDS  NC_007971  66878  69199  -  2322  Cytochrome c  YP_581798  normal  1  normal  0.278439  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5990  CDS  NC_007971  66051  66449  +  399  mercury resistance regulatory protein MerR  YP_581799  normal  1  normal  0.479863  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5991  CDS  NC_007971  65626  65973  -  348  mercury transporter MerT  YP_581800  normal  1  normal  0.681838  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5992    NC_007971  65334  65600  -  267      normal  1  normal  0.460163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5993  CDS  NC_007971  64955  65329  -  375  alkylhydroperoxidase AhpD  YP_581802  normal  1  normal  0.451966  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5994  CDS  NC_007971  63811  64506  +  696  GntR-like protein  YP_581803  normal  1  normal  0.47604  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5995  CDS  NC_007971  62766  63644  -  879  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  YP_581804  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5996  CDS  NC_007971  61984  62766  -  783  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  YP_581805  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5997  CDS  NC_007971  60631  61962  -  1332  Cytosine deaminase-like metal-dependent amidohydrolase  YP_581806  normal  0.75686  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5998  CDS  NC_007971  59115  60359  -  1245  metal-dependent hydrolase  YP_581807  normal  0.403033  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_5999  CDS  NC_007971  57922  58980  -  1059  porin  YP_581808  normal  0.565883  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6000    NC_007971  57535  57810  -  276      normal  0.83864  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6001    NC_007971  56711  57547  +  837      normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6002    NC_007971  56003  56677  +  675      normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6003  CDS  NC_007971  54664  55194  +  531  hypothetical protein  YP_581812  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6004    NC_007971  54329  54541  -  213      normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6005  CDS  NC_007971  52230  54167  -  1938  heat shock protein DnaJ-like protein  YP_581814  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6006  CDS  NC_007971  50917  52092  +  1176  tyr recombinase activity site-specific recombination  YP_581815  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6007  CDS  NC_007971  49487  50491  -  1005  putative restriction endonuclease  YP_581816  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6008    NC_007971  49041  49415  +  375      normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6009  CDS  NC_007971  47691  48530  +  840  putative cysteine peptidase  YP_581818  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6010  CDS  NC_007971  47026  47418  +  393  hypothetical protein  YP_581819  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6011  CDS  NC_007971  46349  46963  +  615  hypothetical protein  YP_581820  normal  0.30638  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6012    NC_007971  45855  46310  +  456      normal  0.167592  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6013  CDS  NC_007971  45234  45662  +  429  hypothetical protein  YP_581822  normal  0.365867  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6014  CDS  NC_007971  43216  45009  +  1794  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  YP_581823  normal  0.605416  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6015  CDS  NC_007971  42165  42818  +  654  hypothetical protein  YP_581824  normal  0.943376  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6016  CDS  NC_007971  41444  41809  +  366  hypothetical protein  YP_581825  normal  0.191133  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6017  CDS  NC_007971  40772  41287  +  516  hypothetical protein  YP_581826  decreased coverage  0.00848458  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6018  CDS  NC_007971  39806  40660  +  855  hypothetical protein  YP_581827  normal  0.0240142  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6019  CDS  NC_007971  38982  39806  +  825  hypothetical protein  YP_581828  normal  0.0930878  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6020  CDS  NC_007971  38605  38865  +  261  hypothetical protein  YP_581829  normal  0.0592726  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6021  CDS  NC_007971  37907  38428  +  522  hypothetical protein  YP_581830  normal  0.0519473  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6022  CDS  NC_007971  37535  37894  +  360  hypothetical protein  YP_581831  normal  0.351486  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6023  CDS  NC_007971  36489  37487  +  999  hypothetical protein  YP_581832  normal  0.903833  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6024  CDS  NC_007971  34863  35834  +  972  putative lipoprotein transmembrane  YP_581833  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6025  CDS  NC_007971  34219  34668  +  450  hypothetical protein  YP_581834  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6026    NC_007971  33438  33938  -  501      normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6027  CDS  NC_007971  32898  33176  -  279  hypothetical protein  YP_581836  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6028  CDS  NC_007971  32540  32908  -  369  hypothetical protein  YP_581837  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6029    NC_007971  32254  32514  -  261      normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6030  CDS  NC_007971  31307  32302  +  996  hypothetical protein  YP_581839  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6031  CDS  NC_007971  30618  31286  +  669  hypothetical protein  YP_581840  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6032  CDS  NC_007971  30190  30561  +  372  toxin of a toxin/antitoxin system  YP_581841  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6033  CDS  NC_007971  29996  30193  +  198  antitoxin of a toxin/antitoxin system  YP_581842  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6034  CDS  NC_007971  29105  29830  -  726  hypothetical protein  YP_581843  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6035  CDS  NC_007971  28158  29108  -  951  hypothetical protein  YP_581844  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6036    NC_007971  27855  28124  -  270      normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6037  CDS  NC_007971  27258  27626  -  369  hypothetical protein  YP_581846  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6038  CDS  NC_007971  26373  26819  -  447  hypothetical protein  YP_581847  normal  0.385038  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6039  CDS  NC_007971  25943  26341  +  399  hypothetical protein  YP_581848  normal  0.850785  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6040  CDS  NC_007971  25251  25631  -  381  hypothetical protein  YP_581849  normal  1  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Rmet_6041  CDS  NC_007971  23676  24482  +  807  hypothetical protein  YP_581850  normal  0.562912  normal  1  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>