33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5944 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_5944    100 
 
 		 939 bp  1861    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  82.69 
 
 		 1185 bp  472  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  80.7 
 
 		 1203 bp  129  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  79.88 
 
 		 1215 bp  125  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5477    100 
 
 		 498 bp  91.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0931864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3368  major facilitator transporter  79.72 
 
 		 1215 bp  81.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  82.68 
 
 		 1221 bp  77.8  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  95.35 
 
 		 1215 bp  69.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  84.71 
 
 		 1203 bp  65.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  84.71 
 
 		 1215 bp  65.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  84.71 
 
 		 1218 bp  65.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  95.12 
 
 		 1224 bp  65.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  93.18 
 
 		 1182 bp  63.9  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  81.25 
 
 		 1206 bp  63.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  95 
 
 		 1194 bp  63.9  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0712  major facilitator superfamily protein  93.02 
 
 		 1209 bp  61.9  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0924904  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1714  major facilitator family transporter  93.02 
 
 		 1209 bp  61.9  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1163  major facilitator family transporter  93.02 
 
 		 1341 bp  61.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1238  major facilitator superfamily protein  93.02 
 
 		 1209 bp  61.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0750  major facilitator family transporter  93.02 
 
 		 1209 bp  61.9  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0810937  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0054  major facilitator transporter  93.02 
 
 		 1212 bp  61.9  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2435  major facilitator superfamily protein  93.02 
 
 		 1341 bp  61.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  91.3 
 
 		 1209 bp  60  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  86.15 
 
 		 1197 bp  58  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  80.47 
 
 		 1206 bp  56  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  90.7 
 
 		 1209 bp  54  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  90.7 
 
 		 1209 bp  54  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  89.36 
 
 		 1209 bp  54  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  87.76 
 
 		 1203 bp  50.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  84.62 
 
 		 1212 bp  50.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  82.02 
 
 		 1209 bp  50.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  87.76 
 
 		 1203 bp  50.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  84.62 
 
 		 1212 bp  50.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>