35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6035 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6035  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  652    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0874  hypothetical protein  58.65 
 
 		 330 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0425  hypothetical protein  58.01 
 
 		 330 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0904  hypothetical protein  58.01 
 
 		 330 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472436  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4370  hypothetical protein  56.87 
 
 		 307 aa  336  2.9999999999999997e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0962975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2871  hypothetical protein  50.17 
 
 		 306 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2176  hypothetical protein  48.2 
 
 		 306 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2404  hypothetical protein  49.14 
 
 		 306 aa  258  7e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1162  hypothetical protein  44.01 
 
 		 304 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1562  hypothetical protein  43.27 
 
 		 306 aa  255  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0933  hypothetical protein  44.92 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1880  hypothetical protein  39.67 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.118335  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1991  hypothetical protein  40 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061979  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1976  hypothetical protein  37.42 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1199  hypothetical protein  36.63 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000053087  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4769  hypothetical protein  37.12 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184998  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4611  hypothetical protein  38.23 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.626183  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0348  hypothetical protein  37.76 
 
 		 304 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.975914  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1964  hypothetical protein  36.07 
 
 		 305 aa  172  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0439  hypothetical protein  38.26 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0688498  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25120  hypothetical protein  46.71 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3364  hypothetical protein  35.62 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.041289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6591  hypothetical protein  34.74 
 
 		 318 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1141  hypothetical protein  40.16 
 
 		 146 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0570  hypothetical protein  35.26 
 
 		 199 aa  82.4  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0196  hypothetical protein  32.68 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11430  protein of unknown function (DUF1814)  24.76 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.442396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6340  hypothetical protein  68.89 
 
 		 65 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.932896  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3349  hypothetical protein  25.89 
 
 		 274 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0068  hypothetical protein  26.47 
 
 		 291 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1879  hypothetical protein  26.52 
 
 		 246 aa  46.6  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.671388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1149  hypothetical protein  23.46 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0715  hypothetical protein  27 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102185 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0784  hypothetical protein  51.35 
 
 		 84 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4888  hypothetical protein  28.57 
 
 		 255 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.608714  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>