29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6591 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6591  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  631  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3364  hypothetical protein  85.08 
 
 		 315 aa  533  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.041289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1964  hypothetical protein  47.47 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1976  hypothetical protein  46.9 
 
 		 307 aa  222  6e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4611  hypothetical protein  43.65 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.626183  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0348  hypothetical protein  40.94 
 
 		 304 aa  205  7e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.975914  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1880  hypothetical protein  41.33 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.118335  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1991  hypothetical protein  41 
 
 		 311 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061979  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0439  hypothetical protein  47.4 
 
 		 305 aa  199  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0688498  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4769  hypothetical protein  41 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184998  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1162  hypothetical protein  42.05 
 
 		 304 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1562  hypothetical protein  40.13 
 
 		 306 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1199  hypothetical protein  36.16 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000053087  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2871  hypothetical protein  38.87 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2176  hypothetical protein  38.16 
 
 		 306 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2404  hypothetical protein  37.46 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0874  hypothetical protein  37.07 
 
 		 330 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0904  hypothetical protein  37.33 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472436  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0425  hypothetical protein  37.33 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0933  hypothetical protein  36.52 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4370  hypothetical protein  35.29 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0962975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6035  hypothetical protein  34.74 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0570  hypothetical protein  45.95 
 
 		 199 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25120  hypothetical protein  38.24 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0196  hypothetical protein  31.6 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11430  protein of unknown function (DUF1814)  29.29 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.442396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1141  hypothetical protein  32.2 
 
 		 146 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6340  hypothetical protein  56.1 
 
 		 65 aa  50.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.932896  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0784  hypothetical protein  57.5 
 
 		 84 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>