35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0904 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0874  hypothetical protein  95.15 
 
 		 330 aa  650    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0425  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  676    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0904  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  676    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472436  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6035  hypothetical protein  58.01 
 
 		 316 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4370  hypothetical protein  55.31 
 
 		 307 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0962975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2176  hypothetical protein  51.32 
 
 		 306 aa  296  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2871  hypothetical protein  50 
 
 		 306 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1562  hypothetical protein  48.4 
 
 		 306 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2404  hypothetical protein  51.52 
 
 		 306 aa  286  4e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1162  hypothetical protein  46.6 
 
 		 304 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0933  hypothetical protein  48.03 
 
 		 284 aa  262  6e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4769  hypothetical protein  39.79 
 
 		 307 aa  209  8e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184998  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1199  hypothetical protein  36.42 
 
 		 308 aa  206  4e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000053087  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4611  hypothetical protein  39.51 
 
 		 310 aa  202  9e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.626183  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1880  hypothetical protein  37.67 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.118335  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1991  hypothetical protein  37.67 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061979  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0348  hypothetical protein  38.41 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.975914  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1976  hypothetical protein  35.99 
 
 		 307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1964  hypothetical protein  36.18 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0439  hypothetical protein  39.86 
 
 		 305 aa  178  9e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0688498  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25120  hypothetical protein  50.93 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3364  hypothetical protein  37.46 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.041289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6591  hypothetical protein  37.33 
 
 		 318 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1141  hypothetical protein  35.96 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0570  hypothetical protein  33.77 
 
 		 199 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0196  hypothetical protein  31.1 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11430  protein of unknown function (DUF1814)  27.92 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.442396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6340  hypothetical protein  60 
 
 		 65 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.932896  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0068  hypothetical protein  27.32 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  24.57 
 
 		 399 aa  50.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1879  hypothetical protein  25.7 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.671388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3349  hypothetical protein  29.57 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0514  hypothetical protein  29.31 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.583693  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1149  hypothetical protein  26.24 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0784  hypothetical protein  46.34 
 
 		 84 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>