27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0068 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0068  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  604  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3349  hypothetical protein  50.41 
 
 
274 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0261  hypothetical protein  47.93 
 
 
271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1149  hypothetical protein  50.82 
 
 
272 aa  235  7e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0715  hypothetical protein  46.86 
 
 
277 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0102185 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0514  hypothetical protein  44.65 
 
 
256 aa  195  8.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.583693  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4888  hypothetical protein  42.92 
 
 
255 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.608714  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0970  hypothetical protein  34.21 
 
 
285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4515  hypothetical protein  29 
 
 
251 aa  96.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  26.88 
 
 
399 aa  65.9  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2937  hypothetical protein  28.19 
 
 
269 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283866  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1879  hypothetical protein  26.49 
 
 
246 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.671388  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4908  Domain of unknown function DUF1814  22.78 
 
 
267 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0874  hypothetical protein  27.72 
 
 
330 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2176  hypothetical protein  25.64 
 
 
306 aa  52.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2404  hypothetical protein  24.62 
 
 
306 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0904  hypothetical protein  27.32 
 
 
330 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472436  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0425  hypothetical protein  27.32 
 
 
330 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4997  hypothetical protein  25.89 
 
 
247 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6035  hypothetical protein  26.47 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2871  hypothetical protein  23.17 
 
 
306 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0196  hypothetical protein  25.37 
 
 
320 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1960  hypothetical protein  42.86 
 
 
327 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.220534 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4769  hypothetical protein  26.7 
 
 
307 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184998  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0953  hypothetical protein  26.19 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1562  hypothetical protein  23.79 
 
 
306 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252328  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1964  hypothetical protein  25.27 
 
 
305 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0455905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>