27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_11430 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_11430  protein of unknown function (DUF1814)  100 
 
 
312 aa  647    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.442396  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0196  hypothetical protein  31.61 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1199  hypothetical protein  27.78 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000053087  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1562  hypothetical protein  26.58 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252328  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1991  hypothetical protein  27.45 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061979  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1880  hypothetical protein  27.12 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.118335  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1964  hypothetical protein  34.36 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4769  hypothetical protein  26.22 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184998  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1162  hypothetical protein  32.53 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0770  hypothetical protein  49.18 
 
 
64 aa  71.6  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.449831  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4611  hypothetical protein  27.33 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.626183  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6035  hypothetical protein  24.76 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2871  hypothetical protein  27.42 
 
 
306 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4370  hypothetical protein  25.08 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0962975  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1976  hypothetical protein  27.47 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0348  hypothetical protein  27.06 
 
 
304 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.975914  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0874  hypothetical protein  28.57 
 
 
330 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6591  hypothetical protein  29.29 
 
 
318 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0904  hypothetical protein  27.92 
 
 
330 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472436  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0425  hypothetical protein  27.92 
 
 
330 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2176  hypothetical protein  26.42 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2404  hypothetical protein  29.52 
 
 
306 aa  60.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3364  hypothetical protein  27.8 
 
 
315 aa  59.7  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.041289  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0439  hypothetical protein  32.48 
 
 
305 aa  52.8  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0688498  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0933  hypothetical protein  25.85 
 
 
284 aa  50.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4997  hypothetical protein  25.11 
 
 
247 aa  49.7  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0570  hypothetical protein  58.06 
 
 
199 aa  43.5  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>