31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1162 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1162  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  609  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1562  hypothetical protein  82.12 
 
 
306 aa  508  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252328  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2871  hypothetical protein  49.5 
 
 
306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2176  hypothetical protein  51.01 
 
 
306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0874  hypothetical protein  47.08 
 
 
330 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2404  hypothetical protein  50.68 
 
 
306 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0425  hypothetical protein  46.6 
 
 
330 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0904  hypothetical protein  46.6 
 
 
330 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472436  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4370  hypothetical protein  46.2 
 
 
307 aa  264  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0962975  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6035  hypothetical protein  44.01 
 
 
316 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0933  hypothetical protein  48.31 
 
 
284 aa  252  7e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4611  hypothetical protein  45.7 
 
 
310 aa  221  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.626183  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1199  hypothetical protein  40.48 
 
 
308 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000053087  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1976  hypothetical protein  43.46 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1964  hypothetical protein  42.11 
 
 
305 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0348  hypothetical protein  41.97 
 
 
304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.975914  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4769  hypothetical protein  41.78 
 
 
307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184998  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1880  hypothetical protein  41.48 
 
 
311 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.118335  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1991  hypothetical protein  41.16 
 
 
311 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061979  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3364  hypothetical protein  42.24 
 
 
315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.041289  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0439  hypothetical protein  43.75 
 
 
305 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0688498  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6591  hypothetical protein  42.05 
 
 
318 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25120  hypothetical protein  50.31 
 
 
304 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1141  hypothetical protein  35.94 
 
 
146 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0570  hypothetical protein  40.26 
 
 
199 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0196  hypothetical protein  29.54 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6340  hypothetical protein  88.89 
 
 
65 aa  82.4  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.932896  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11430  protein of unknown function (DUF1814)  32.53 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.442396  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0784  hypothetical protein  43.66 
 
 
84 aa  52.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1149  hypothetical protein  28.31 
 
 
272 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1879  hypothetical protein  28.07 
 
 
246 aa  42.7  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.671388  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>