40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4997 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4997  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  505  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  38.62 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1879  hypothetical protein  36.73 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.671388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4908  Domain of unknown function DUF1814  33.02 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2937  hypothetical protein  29.91 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283866  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4391  hypothetical protein  54.9 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0300  hypothetical protein  28.02 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3205  hypothetical protein  27.54 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1881  hypothetical protein  61.54 
 
 		 93 aa  54.7  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1821  hypothetical protein  42.62 
 
 		 327 aa  52.8  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0191  Domain of unknown function DUF1814  27.75 
 
 		 250 aa  52  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233104  hitchhiker  0.00266112 
 
 
-
 
NC_002950  PG0848  hypothetical protein  39.29 
 
 		 332 aa  52  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264923 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1225  hypothetical protein  40.91 
 
 		 338 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3510  hypothetical protein  40.91 
 
 		 338 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0233034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11430  protein of unknown function (DUF1814)  25.11 
 
 		 312 aa  49.7  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.442396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3057  protein of unknown function DUF1814  40.91 
 
 		 338 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1960  hypothetical protein  33.33 
 
 		 327 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.220534 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0068  hypothetical protein  25.89 
 
 		 291 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3046  hypothetical protein  40.91 
 
 		 338 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137225  normal  0.0781322 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0434  hypothetical protein  38.24 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421274  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1420  Domain of unknown function DUF1814  42.62 
 
 		 338 aa  47.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4355  hypothetical protein  43.64 
 
 		 341 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3050  hypothetical protein  41.94 
 
 		 345 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.818716 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0281  hypothetical protein  40.98 
 
 		 328 aa  46.2  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0970  hypothetical protein  29.69 
 
 		 285 aa  45.4  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1625  hypothetical protein  34.52 
 
 		 339 aa  45.4  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0890  hypothetical protein  41.82 
 
 		 337 aa  45.4  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000838663  hitchhiker  0.00000000010514 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0261  hypothetical protein  28.21 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0394  hypothetical protein  43.14 
 
 		 342 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3801  hypothetical protein  28.04 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0441026  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1610  hypothetical protein  30.98 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3349  hypothetical protein  28.71 
 
 		 274 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3302  hypothetical protein  28.64 
 
 		 348 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1776  hypothetical protein  44.23 
 
 		 326 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1149  hypothetical protein  27.27 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2490  hypothetical protein  37.74 
 
 		 346 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0715  hypothetical protein  27.69 
 
 		 277 aa  42.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102185 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0052  hypothetical protein  54.76 
 
 		 355 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.962002  unclonable  0.0000116494 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6000  hypothetical protein  25.14 
 
 		 261 aa  42.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1328  hypothetical protein  37.88 
 
 		 348 aa  42  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>