43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1328 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1328  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  708    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261253  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3510  hypothetical protein  62.2 
 
 
338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0233034  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1225  hypothetical protein  62.2 
 
 
338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3046  hypothetical protein  61.19 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137225  normal  0.0781322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3057  protein of unknown function DUF1814  62.39 
 
 
338 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1420  Domain of unknown function DUF1814  37.39 
 
 
338 aa  211  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0434  hypothetical protein  36.36 
 
 
339 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421274  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0394  hypothetical protein  34.3 
 
 
342 aa  195  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1625  hypothetical protein  34.8 
 
 
339 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5265  hypothetical protein  36.1 
 
 
348 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00288645  unclonable  0.000020149 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2490  hypothetical protein  32.11 
 
 
346 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1776  hypothetical protein  36.23 
 
 
326 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0052  hypothetical protein  34.25 
 
 
355 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.962002  unclonable  0.0000116494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3050  hypothetical protein  34.1 
 
 
345 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.818716 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0218  hypothetical protein  32.07 
 
 
331 aa  143  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0784  hypothetical protein  31.49 
 
 
368 aa  143  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4292  hypothetical protein  31.23 
 
 
344 aa  142  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0281  hypothetical protein  31.98 
 
 
328 aa  139  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4355  hypothetical protein  31.61 
 
 
341 aa  136  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678013  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1821  hypothetical protein  26.6 
 
 
327 aa  127  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7702  hypothetical protein  32.07 
 
 
347 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119439 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1847  hypothetical protein  28.65 
 
 
361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.283474 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0890  hypothetical protein  27.84 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000838663  hitchhiker  0.00000000010514 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0754  hypothetical protein  25.14 
 
 
332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2334  hypothetical protein  30.35 
 
 
359 aa  116  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.937968  normal  0.0991632 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf137  hypothetical protein  26.81 
 
 
346 aa  112  9e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0341957  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3786  hypothetical protein  24.78 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2171  hypothetical protein  33.33 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690317  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0848  hypothetical protein  39.36 
 
 
332 aa  65.9  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264923 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1569  hypothetical protein  29.54 
 
 
321 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110325  normal  0.0638438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1960  hypothetical protein  42.86 
 
 
327 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.220534 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0294  hypothetical protein  34.86 
 
 
329 aa  57.4  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2690  hypothetical protein  46.05 
 
 
187 aa  57.4  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5493  hypothetical protein  23.36 
 
 
326 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595144  normal  0.225489 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2544  hypothetical protein  44.78 
 
 
318 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117379  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2408  hypothetical protein  42.19 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2452  hypothetical protein  44.62 
 
 
308 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.48779  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4654  Domain of unknown function DUF1814  26.97 
 
 
335 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.929553  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0213  hypothetical protein  27.16 
 
 
315 aa  47.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.703328  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5328  hypothetical protein  43.86 
 
 
83 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4457  hypothetical protein  45.1 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4161  hypothetical protein  45.1 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.162977 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06811  hypothetical protein  45.1 
 
 
313 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>