29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0715 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0715  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0102185 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0514  hypothetical protein  75 
 
 
256 aa  413  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.583693  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1149  hypothetical protein  59.02 
 
 
272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3349  hypothetical protein  57.88 
 
 
274 aa  310  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0261  hypothetical protein  56.44 
 
 
271 aa  294  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0068  hypothetical protein  46.86 
 
 
291 aa  215  5.9999999999999996e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4888  hypothetical protein  46.25 
 
 
255 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.608714  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4515  hypothetical protein  31.33 
 
 
251 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0970  hypothetical protein  31.7 
 
 
285 aa  112  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2937  hypothetical protein  29.29 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  22.5 
 
 
399 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4908  Domain of unknown function DUF1814  24.4 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4355  hypothetical protein  41.67 
 
 
341 aa  50.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678013  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2404  hypothetical protein  26.92 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0191  Domain of unknown function DUF1814  26.42 
 
 
250 aa  46.6  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233104  hitchhiker  0.00266112 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2176  hypothetical protein  26.37 
 
 
306 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3057  protein of unknown function DUF1814  33.63 
 
 
338 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1879  hypothetical protein  26.63 
 
 
246 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.671388  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3046  hypothetical protein  33.63 
 
 
338 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137225  normal  0.0781322 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1776  hypothetical protein  38.36 
 
 
326 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6035  hypothetical protein  27 
 
 
316 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0281  hypothetical protein  35.9 
 
 
328 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0196  hypothetical protein  26.97 
 
 
320 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1960  hypothetical protein  46.94 
 
 
327 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.220534 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0874  hypothetical protein  29.14 
 
 
330 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4997  hypothetical protein  27.69 
 
 
247 aa  42.7  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4370  hypothetical protein  27.08 
 
 
307 aa  42.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0962975  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3510  hypothetical protein  31.86 
 
 
338 aa  42  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0233034  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1225  hypothetical protein  31.86 
 
 
338 aa  42  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>