12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4515 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4515  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0970  hypothetical protein  46.29 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0261  hypothetical protein  35.27 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0715  hypothetical protein  31.33 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102185 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3349  hypothetical protein  33.2 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0514  hypothetical protein  34.4 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.583693  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4888  hypothetical protein  32.46 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.608714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1149  hypothetical protein  31.12 
 
 		 272 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0068  hypothetical protein  29 
 
 		 291 aa  96.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  25.14 
 
 		 399 aa  53.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1879  hypothetical protein  25.37 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.671388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1610  hypothetical protein  26.16 
 
 		 234 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>