56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1879 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1879  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.671388  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  51.94 
 
 
399 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4997  hypothetical protein  36.73 
 
 
247 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2937  hypothetical protein  33.01 
 
 
269 aa  85.1  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283866  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4391  hypothetical protein  52.78 
 
 
78 aa  83.2  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4908  Domain of unknown function DUF1814  30.77 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0068  hypothetical protein  26.49 
 
 
291 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0754  hypothetical protein  41.79 
 
 
332 aa  54.3  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1776  hypothetical protein  45.59 
 
 
326 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2490  hypothetical protein  42.59 
 
 
346 aa  53.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1821  hypothetical protein  37.31 
 
 
327 aa  52.4  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3801  hypothetical protein  26.09 
 
 
259 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0441026  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1285  abortive infection protein AbiGII  25.54 
 
 
281 aa  51.6  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5265  hypothetical protein  41.18 
 
 
348 aa  49.3  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00288645  unclonable  0.000020149 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4355  hypothetical protein  39.71 
 
 
341 aa  48.9  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678013  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1149  hypothetical protein  24.88 
 
 
272 aa  48.9  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf137  hypothetical protein  40.32 
 
 
346 aa  48.5  0.00009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0341957  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4515  hypothetical protein  25.37 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0904  hypothetical protein  25.7 
 
 
330 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472436  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0425  hypothetical protein  25.7 
 
 
330 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0191  Domain of unknown function DUF1814  26.09 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233104  hitchhiker  0.00266112 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3349  hypothetical protein  26.52 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6035  hypothetical protein  26.52 
 
 
316 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0874  hypothetical protein  23.89 
 
 
330 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0281  hypothetical protein  38.24 
 
 
328 aa  46.6  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1847  hypothetical protein  40.98 
 
 
361 aa  46.2  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.283474 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0970  hypothetical protein  27.6 
 
 
285 aa  46.2  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3205  hypothetical protein  26.94 
 
 
296 aa  45.4  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42811  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0213  hypothetical protein  26.14 
 
 
315 aa  45.4  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.703328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4654  Domain of unknown function DUF1814  42.19 
 
 
335 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.929553  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1960  hypothetical protein  39.68 
 
 
327 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.220534 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0715  hypothetical protein  25.54 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0102185 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4161  hypothetical protein  26.27 
 
 
313 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.162977 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3302  hypothetical protein  28.5 
 
 
348 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52051  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3050  hypothetical protein  48.08 
 
 
345 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.818716 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1420  Domain of unknown function DUF1814  42.62 
 
 
338 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0848  hypothetical protein  41.51 
 
 
332 aa  44.3  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264923 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0200  hypothetical protein  38.57 
 
 
315 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4457  hypothetical protein  25.85 
 
 
313 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0784  hypothetical protein  36.23 
 
 
368 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5493  hypothetical protein  43.28 
 
 
326 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595144  normal  0.225489 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06811  hypothetical protein  34.21 
 
 
313 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0294  hypothetical protein  33.82 
 
 
329 aa  43.5  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3510  hypothetical protein  40.68 
 
 
338 aa  43.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0233034  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1225  hypothetical protein  40.68 
 
 
338 aa  43.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1303  hypothetical protein  24.66 
 
 
322 aa  42.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.240695  hitchhiker  0.000000000778686 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2171  hypothetical protein  39.71 
 
 
314 aa  43.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690317  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1162  hypothetical protein  28.07 
 
 
304 aa  42.4  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3046  hypothetical protein  42.37 
 
 
338 aa  42.4  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137225  normal  0.0781322 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4292  hypothetical protein  35.14 
 
 
344 aa  42.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3057  protein of unknown function DUF1814  42.37 
 
 
338 aa  42.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1368  hypothetical protein  30.11 
 
 
290 aa  42.4  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80358  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0890  hypothetical protein  33.87 
 
 
337 aa  42.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000838663  hitchhiker  0.00000000010514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0394  hypothetical protein  40.26 
 
 
342 aa  42  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2334  hypothetical protein  36.36 
 
 
359 aa  42  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.937968  normal  0.0991632 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11430  protein of unknown function (DUF1814)  26.21 
 
 
312 aa  42  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.442396  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>