44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0213 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0213  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  632  1e-180  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.703328  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1569  hypothetical protein  37.35 
 
 		 321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110325  normal  0.0638438 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2544  hypothetical protein  34.59 
 
 		 318 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2452  hypothetical protein  34.58 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.48779  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0200  hypothetical protein  31.27 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06811  hypothetical protein  32.73 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4161  hypothetical protein  32.26 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162977 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4457  hypothetical protein  31.9 
 
 		 313 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3417  hypothetical protein  32.45 
 
 		 315 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2408  hypothetical protein  27.53 
 
 		 308 aa  105  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3691  hypothetical protein  30.51 
 
 		 257 aa  97.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.795746 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0717  hypothetical protein  30.66 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1969  hypothetical protein  30.8 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0848  hypothetical protein  25.08 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264923 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0281  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  28.96 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1776  hypothetical protein  33.7 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3302  hypothetical protein  27.64 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0784  hypothetical protein  28.22 
 
 		 368 aa  53.1  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3057  protein of unknown function DUF1814  28.63 
 
 		 338 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1225  hypothetical protein  27.34 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3510  hypothetical protein  27.34 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0233034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1847  hypothetical protein  26.67 
 
 		 361 aa  49.7  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283474 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0218  hypothetical protein  27.47 
 
 		 331 aa  49.7  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0754  hypothetical protein  25.19 
 
 		 332 aa  48.5  0.0001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2171  hypothetical protein  26.75 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690317  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3786  hypothetical protein  48.33 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7702  hypothetical protein  49.09 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119439 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1328  hypothetical protein  31.48 
 
 		 348 aa  47.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261253  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0434  hypothetical protein  31.85 
 
 		 339 aa  47.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421274  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3046  hypothetical protein  27.42 
 
 		 338 aa  47  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137225  normal  0.0781322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2334  hypothetical protein  50.98 
 
 		 359 aa  46.6  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.937968  normal  0.0991632 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf137  hypothetical protein  24.24 
 
 		 346 aa  45.8  0.0009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0341957  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3050  hypothetical protein  24.79 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.818716 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1879  hypothetical protein  26.14 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.671388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1821  hypothetical protein  42.86 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4292  hypothetical protein  37.5 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5265  hypothetical protein  48.21 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00288645  unclonable  0.000020149 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0052  hypothetical protein  34.82 
 
 		 355 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.962002  unclonable  0.0000116494 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2690  hypothetical protein  40 
 
 		 187 aa  43.5  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1625  hypothetical protein  27.03 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1420  Domain of unknown function DUF1814  51.06 
 
 		 338 aa  43.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0394  hypothetical protein  28.11 
 
 		 342 aa  43.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0890  hypothetical protein  51.02 
 
 		 337 aa  43.1  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000838663  hitchhiker  0.00000000010514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>