48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2334 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2334  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  733    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.937968  normal  0.0991632 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0784  hypothetical protein  59.54 
 
 		 368 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4292  hypothetical protein  60.77 
 
 		 344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7702  hypothetical protein  55.1 
 
 		 347 aa  391  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119439 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1847  hypothetical protein  54.87 
 
 		 361 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283474 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2490  hypothetical protein  36.52 
 
 		 346 aa  199  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4355  hypothetical protein  38.76 
 
 		 341 aa  179  7e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0434  hypothetical protein  32.83 
 
 		 339 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421274  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5265  hypothetical protein  35.91 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00288645  unclonable  0.000020149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3050  hypothetical protein  35.78 
 
 		 345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.818716 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1776  hypothetical protein  34.68 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1625  hypothetical protein  33.13 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1420  Domain of unknown function DUF1814  32.93 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0394  hypothetical protein  32.64 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0218  hypothetical protein  35.76 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0281  hypothetical protein  32.37 
 
 		 328 aa  152  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1821  hypothetical protein  28.96 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0890  hypothetical protein  31.66 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000838663  hitchhiker  0.00000000010514 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0754  hypothetical protein  26.67 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf137  hypothetical protein  27.83 
 
 		 346 aa  133  6e-30  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0341957  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1328  hypothetical protein  30.35 
 
 		 348 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261253  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1225  hypothetical protein  30.86 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3510  hypothetical protein  30.86 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0233034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3046  hypothetical protein  32.05 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137225  normal  0.0781322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3057  protein of unknown function DUF1814  31.18 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3786  hypothetical protein  27.49 
 
 		 335 aa  95.9  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0052  hypothetical protein  26.05 
 
 		 355 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.962002  unclonable  0.0000116494 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1960  hypothetical protein  24.47 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.220534 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5493  hypothetical protein  27.81 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595144  normal  0.225489 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0294  hypothetical protein  26.65 
 
 		 329 aa  67  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0848  hypothetical protein  40.54 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2171  hypothetical protein  25.79 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690317  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1569  hypothetical protein  29.8 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110325  normal  0.0638438 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2690  hypothetical protein  54.9 
 
 		 187 aa  53.5  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4654  Domain of unknown function DUF1814  24.06 
 
 		 335 aa  50.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.929553  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2408  hypothetical protein  43.55 
 
 		 308 aa  49.7  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0717  hypothetical protein  58.33 
 
 		 299 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1969  hypothetical protein  58.33 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0200  hypothetical protein  31.87 
 
 		 315 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0213  hypothetical protein  50.98 
 
 		 315 aa  46.6  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.703328  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5328  hypothetical protein  42.62 
 
 		 83 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4457  hypothetical protein  25.91 
 
 		 313 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  41.38 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2452  hypothetical protein  45.76 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.48779  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0191  Domain of unknown function DUF1814  36 
 
 		 250 aa  43.9  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233104  hitchhiker  0.00266112 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2544  hypothetical protein  45.76 
 
 		 318 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4391  hypothetical protein  34.85 
 
 		 78 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4161  hypothetical protein  23.48 
 
 		 313 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162977 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>