37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5328 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010333  Caul_5328  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  176  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2690  hypothetical protein  58.57 
 
 
187 aa  91.3  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2171  hypothetical protein  55.71 
 
 
314 aa  87.8  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690317  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0294  hypothetical protein  57.75 
 
 
329 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0218  hypothetical protein  54 
 
 
331 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_002950  PG0848  hypothetical protein  42.47 
 
 
332 aa  54.7  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264923 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4292  hypothetical protein  54.17 
 
 
344 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5265  hypothetical protein  43.48 
 
 
348 aa  50.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00288645  unclonable  0.000020149 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1776  hypothetical protein  46 
 
 
326 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1821  hypothetical protein  40.28 
 
 
327 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4355  hypothetical protein  39.13 
 
 
341 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678013  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3302  hypothetical protein  40.54 
 
 
348 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52051  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1420  Domain of unknown function DUF1814  38.96 
 
 
338 aa  48.9  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3050  hypothetical protein  44.83 
 
 
345 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.818716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1960  hypothetical protein  38.03 
 
 
327 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.220534 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0754  hypothetical protein  33.33 
 
 
332 aa  48.1  0.00004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3510  hypothetical protein  40.91 
 
 
338 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0233034  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1225  hypothetical protein  40.91 
 
 
338 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0890  hypothetical protein  43.55 
 
 
337 aa  47.4  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000838663  hitchhiker  0.00000000010514 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf137  hypothetical protein  38.57 
 
 
346 aa  47  0.00008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0341957  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4161  hypothetical protein  48.08 
 
 
313 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.162977 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3046  hypothetical protein  39.39 
 
 
338 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137225  normal  0.0781322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7702  hypothetical protein  48.33 
 
 
347 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119439 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4457  hypothetical protein  48.08 
 
 
313 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3057  protein of unknown function DUF1814  39.39 
 
 
338 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2334  hypothetical protein  42.62 
 
 
359 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.937968  normal  0.0991632 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2490  hypothetical protein  44 
 
 
346 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1328  hypothetical protein  43.86 
 
 
348 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261253  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0784  hypothetical protein  47.92 
 
 
368 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0394  hypothetical protein  35.21 
 
 
342 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0281  hypothetical protein  42.86 
 
 
328 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1847  hypothetical protein  49.02 
 
 
361 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.283474 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0717  hypothetical protein  39.39 
 
 
299 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0716673  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0434  hypothetical protein  45.45 
 
 
339 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421274  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1625  hypothetical protein  44.26 
 
 
339 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4654  Domain of unknown function DUF1814  36.62 
 
 
335 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.929553  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3786  hypothetical protein  43.86 
 
 
335 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>