50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1225 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3510  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  683    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0233034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1225  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  683    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3046  hypothetical protein  88.32 
 
 		 338 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137225  normal  0.0781322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3057  protein of unknown function DUF1814  88.32 
 
 		 338 aa  587  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1328  hypothetical protein  62.2 
 
 		 348 aa  387  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261253  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0394  hypothetical protein  36.73 
 
 		 342 aa  207  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1420  Domain of unknown function DUF1814  36.13 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0434  hypothetical protein  33.43 
 
 		 339 aa  190  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421274  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1625  hypothetical protein  33.54 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0784  hypothetical protein  36.16 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4355  hypothetical protein  32.2 
 
 		 341 aa  145  7.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5265  hypothetical protein  33.43 
 
 		 348 aa  145  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00288645  unclonable  0.000020149 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1776  hypothetical protein  33.82 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2490  hypothetical protein  29.85 
 
 		 346 aa  143  5e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0218  hypothetical protein  33.13 
 
 		 331 aa  139  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0281  hypothetical protein  30.64 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3050  hypothetical protein  33.33 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.818716 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0052  hypothetical protein  30.7 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.962002  unclonable  0.0000116494 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4292  hypothetical protein  31.32 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0890  hypothetical protein  28.4 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000838663  hitchhiker  0.00000000010514 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1821  hypothetical protein  26.19 
 
 		 327 aa  122  6e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7702  hypothetical protein  31.91 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119439 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2334  hypothetical protein  30.86 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.937968  normal  0.0991632 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1847  hypothetical protein  30.49 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283474 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0754  hypothetical protein  24.26 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf137  hypothetical protein  24.62 
 
 		 346 aa  104  3e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0341957  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1960  hypothetical protein  29.23 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.220534 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3786  hypothetical protein  27.47 
 
 		 335 aa  67  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1569  hypothetical protein  33.33 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110325  normal  0.0638438 
 
 
-
 
NC_002950  PG0848  hypothetical protein  35.87 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264923 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2690  hypothetical protein  37.07 
 
 		 187 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2171  hypothetical protein  30.29 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690317  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5493  hypothetical protein  25.32 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595144  normal  0.225489 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0294  hypothetical protein  33.96 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0213  hypothetical protein  27.34 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.703328  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4997  hypothetical protein  40.91 
 
 		 247 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  43.64 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2544  hypothetical protein  50.77 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2452  hypothetical protein  50.77 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.48779  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5328  hypothetical protein  40.91 
 
 		 83 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06811  hypothetical protein  48.15 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4457  hypothetical protein  50 
 
 		 313 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4161  hypothetical protein  50 
 
 		 313 aa  47  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162977 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2408  hypothetical protein  48.15 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4654  Domain of unknown function DUF1814  38.24 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.929553  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2937  hypothetical protein  48.84 
 
 		 269 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283866  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0200  hypothetical protein  38.1 
 
 		 315 aa  43.5  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4391  hypothetical protein  39.34 
 
 		 78 aa  43.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4908  Domain of unknown function DUF1814  41.54 
 
 		 267 aa  43.1  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1879  hypothetical protein  40.68 
 
 		 246 aa  42.7  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.671388  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>