39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3786 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3786  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  701    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1821  hypothetical protein  30.67 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0754  hypothetical protein  28.79 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1776  hypothetical protein  30.55 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf137  hypothetical protein  28.44 
 
 		 346 aa  107  2e-22  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0341957  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0394  hypothetical protein  28.53 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3050  hypothetical protein  29.31 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.818716 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2490  hypothetical protein  28.62 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4292  hypothetical protein  27.44 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1420  Domain of unknown function DUF1814  28.35 
 
 		 338 aa  98.2  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2334  hypothetical protein  27.49 
 
 		 359 aa  95.9  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.937968  normal  0.0991632 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0434  hypothetical protein  29.78 
 
 		 339 aa  95.1  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421274  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0281  hypothetical protein  29.23 
 
 		 328 aa  92.4  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0218  hypothetical protein  30.27 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1625  hypothetical protein  28.93 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5265  hypothetical protein  28.21 
 
 		 348 aa  90.1  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00288645  unclonable  0.000020149 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0890  hypothetical protein  32.59 
 
 		 337 aa  89.7  7e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000838663  hitchhiker  0.00000000010514 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4355  hypothetical protein  29 
 
 		 341 aa  86.3  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1847  hypothetical protein  28.53 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283474 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7702  hypothetical protein  29.41 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0784  hypothetical protein  27.68 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0052  hypothetical protein  31.4 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.962002  unclonable  0.0000116494 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3046  hypothetical protein  27.51 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137225  normal  0.0781322 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1328  hypothetical protein  27.2 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261253  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3057  protein of unknown function DUF1814  27.31 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3510  hypothetical protein  27.47 
 
 		 338 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0233034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1225  hypothetical protein  27.47 
 
 		 338 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0294  hypothetical protein  26.34 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5493  hypothetical protein  28.86 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595144  normal  0.225489 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1569  hypothetical protein  25 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110325  normal  0.0638438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1960  hypothetical protein  25.86 
 
 		 327 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.220534 
 
 
-
 
NC_002950  PG0848  hypothetical protein  45.07 
 
 		 332 aa  52.8  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264923 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2544  hypothetical protein  45 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2452  hypothetical protein  45 
 
 		 308 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.48779  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0200  hypothetical protein  40.62 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0213  hypothetical protein  48.33 
 
 		 315 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.703328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4654  Domain of unknown function DUF1814  25.32 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.929553  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2408  hypothetical protein  45.76 
 
 		 308 aa  46.2  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3417  hypothetical protein  35.63 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>