33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3417 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3417  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  652    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06811  hypothetical protein  44.09 
 
 		 313 aa  268  8e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4161  hypothetical protein  41.9 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162977 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4457  hypothetical protein  42.22 
 
 		 313 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0200  hypothetical protein  29.57 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0213  hypothetical protein  32.45 
 
 		 315 aa  122  6e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.703328  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1569  hypothetical protein  28.09 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110325  normal  0.0638438 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2544  hypothetical protein  28.24 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2452  hypothetical protein  28.24 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.48779  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2408  hypothetical protein  29.69 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3691  hypothetical protein  29.24 
 
 		 257 aa  89  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.795746 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0717  hypothetical protein  28.21 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1969  hypothetical protein  26.1 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0218  hypothetical protein  27.8 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5265  hypothetical protein  26.5 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00288645  unclonable  0.000020149 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1776  hypothetical protein  29.52 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0754  hypothetical protein  26.27 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0890  hypothetical protein  31.29 
 
 		 337 aa  54.3  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000838663  hitchhiker  0.00000000010514 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0281  hypothetical protein  29.45 
 
 		 328 aa  53.5  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3050  hypothetical protein  34.31 
 
 		 345 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.818716 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2171  hypothetical protein  25.43 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690317  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0294  hypothetical protein  23.75 
 
 		 329 aa  50.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0848  hypothetical protein  25.11 
 
 		 332 aa  49.7  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264923 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0434  hypothetical protein  26.26 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421274  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0394  hypothetical protein  23.87 
 
 		 342 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf137  hypothetical protein  42.86 
 
 		 346 aa  47.4  0.0003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0341957  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3786  hypothetical protein  35.63 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4355  hypothetical protein  43.14 
 
 		 341 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1625  hypothetical protein  25.82 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0052  hypothetical protein  24.61 
 
 		 355 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.962002  unclonable  0.0000116494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7702  hypothetical protein  43.08 
 
 		 347 aa  42.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119439 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1821  hypothetical protein  42.59 
 
 		 327 aa  42.7  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4292  hypothetical protein  26.25 
 
 		 344 aa  42.7  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>