26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1969 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1969  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  608  1e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0717  hypothetical protein  76.35 
 
 		 299 aa  456  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06811  hypothetical protein  29.74 
 
 		 313 aa  92.4  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0200  hypothetical protein  27.37 
 
 		 315 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0213  hypothetical protein  30.8 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.703328  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4161  hypothetical protein  28 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1569  hypothetical protein  31.28 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110325  normal  0.0638438 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4457  hypothetical protein  28 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2544  hypothetical protein  30.3 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2452  hypothetical protein  30.3 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.48779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3417  hypothetical protein  26.1 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2408  hypothetical protein  25.17 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2171  hypothetical protein  28.04 
 
 		 314 aa  52.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690317  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4292  hypothetical protein  58.33 
 
 		 344 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2334  hypothetical protein  58.33 
 
 		 359 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.937968  normal  0.0991632 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0784  hypothetical protein  56.86 
 
 		 368 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0218  hypothetical protein  28 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2690  hypothetical protein  45.28 
 
 		 187 aa  47  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0890  hypothetical protein  43.94 
 
 		 337 aa  44.3  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000838663  hitchhiker  0.00000000010514 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5265  hypothetical protein  29.83 
 
 		 348 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00288645  unclonable  0.000020149 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf137  hypothetical protein  41.67 
 
 		 346 aa  43.9  0.003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0341957  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0848  hypothetical protein  51.02 
 
 		 332 aa  43.9  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264923 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1821  hypothetical protein  50 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0294  hypothetical protein  25.88 
 
 		 329 aa  43.5  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1847  hypothetical protein  56.25 
 
 		 361 aa  42.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283474 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1776  hypothetical protein  45.76 
 
 		 326 aa  42.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>