44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2544 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2544  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2452  hypothetical protein  99.68 
 
 
308 aa  630  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.48779  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1569  hypothetical protein  45.62 
 
 
321 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110325  normal  0.0638438 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0213  hypothetical protein  34.59 
 
 
315 aa  156  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.703328  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06811  hypothetical protein  30.25 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4161  hypothetical protein  31.76 
 
 
313 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.162977 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4457  hypothetical protein  31.76 
 
 
313 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0200  hypothetical protein  28.57 
 
 
315 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3417  hypothetical protein  28.24 
 
 
315 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3691  hypothetical protein  33.33 
 
 
257 aa  90.1  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.795746 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0717  hypothetical protein  30.8 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0716673  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2408  hypothetical protein  30.1 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1969  hypothetical protein  30.3 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0848  hypothetical protein  25.76 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264923 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3302  hypothetical protein  29.44 
 
 
348 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52051  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0281  hypothetical protein  46.25 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3050  hypothetical protein  46.27 
 
 
345 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.818716 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1328  hypothetical protein  44.78 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261253  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0394  hypothetical protein  46.3 
 
 
342 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2490  hypothetical protein  31.06 
 
 
346 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1821  hypothetical protein  27.27 
 
 
327 aa  50.4  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1776  hypothetical protein  50 
 
 
326 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0890  hypothetical protein  50.94 
 
 
337 aa  50.1  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000838663  hitchhiker  0.00000000010514 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3786  hypothetical protein  45 
 
 
335 aa  49.7  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0784  hypothetical protein  26.38 
 
 
368 aa  50.1  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0218  hypothetical protein  26.34 
 
 
331 aa  49.3  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4654  Domain of unknown function DUF1814  28.12 
 
 
335 aa  49.3  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.929553  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1420  Domain of unknown function DUF1814  34.82 
 
 
338 aa  48.5  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3510  hypothetical protein  50.77 
 
 
338 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0233034  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1225  hypothetical protein  50.77 
 
 
338 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7702  hypothetical protein  36.27 
 
 
347 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1960  hypothetical protein  23.89 
 
 
327 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.220534 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0052  hypothetical protein  39.76 
 
 
355 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.962002  unclonable  0.0000116494 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0434  hypothetical protein  43.06 
 
 
339 aa  46.2  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421274  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4292  hypothetical protein  25.98 
 
 
344 aa  46.2  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf137  hypothetical protein  44.83 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0341957  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3046  hypothetical protein  49.23 
 
 
338 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137225  normal  0.0781322 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5265  hypothetical protein  37.33 
 
 
348 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00288645  unclonable  0.000020149 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0294  hypothetical protein  34.72 
 
 
329 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0754  hypothetical protein  39.62 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2690  hypothetical protein  33.75 
 
 
187 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2334  hypothetical protein  45.76 
 
 
359 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.937968  normal  0.0991632 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1625  hypothetical protein  42.47 
 
 
339 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1847  hypothetical protein  26.67 
 
 
361 aa  43.9  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.283474 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>