34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4391 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4391  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  160  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  55.56 
 
 
399 aa  86.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1879  hypothetical protein  52.78 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.671388  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4997  hypothetical protein  54.9 
 
 
247 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4908  Domain of unknown function DUF1814  46.38 
 
 
267 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2937  hypothetical protein  44.93 
 
 
269 aa  60.5  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283866  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0848  hypothetical protein  40 
 
 
332 aa  53.5  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264923 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3801  hypothetical protein  34.18 
 
 
259 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0441026  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2490  hypothetical protein  50 
 
 
346 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1960  hypothetical protein  36.76 
 
 
327 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.220534 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1776  hypothetical protein  37.1 
 
 
326 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3302  hypothetical protein  38.1 
 
 
348 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52051  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0754  hypothetical protein  40.62 
 
 
332 aa  47.8  0.00005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0281  hypothetical protein  43.1 
 
 
328 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0784  hypothetical protein  37.88 
 
 
368 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0191  Domain of unknown function DUF1814  36.36 
 
 
250 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233104  hitchhiker  0.00266112 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4292  hypothetical protein  37.88 
 
 
344 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7702  hypothetical protein  36.36 
 
 
347 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119439 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5265  hypothetical protein  37.1 
 
 
348 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00288645  unclonable  0.000020149 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4355  hypothetical protein  38.1 
 
 
341 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678013  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0890  hypothetical protein  40 
 
 
337 aa  45.1  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000838663  hitchhiker  0.00000000010514 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1847  hypothetical protein  35.38 
 
 
361 aa  43.9  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.283474 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2334  hypothetical protein  34.85 
 
 
359 aa  43.5  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.937968  normal  0.0991632 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3510  hypothetical protein  39.34 
 
 
338 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0233034  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3057  protein of unknown function DUF1814  40.98 
 
 
338 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3046  hypothetical protein  40.98 
 
 
338 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137225  normal  0.0781322 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1225  hypothetical protein  39.34 
 
 
338 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf137  hypothetical protein  39.06 
 
 
346 aa  42.7  0.002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0341957  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1625  hypothetical protein  46.67 
 
 
339 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0261  hypothetical protein  35.71 
 
 
271 aa  42  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4654  Domain of unknown function DUF1814  41.82 
 
 
335 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.929553  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3050  hypothetical protein  43.86 
 
 
345 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.818716 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0715  hypothetical protein  32.2 
 
 
277 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0102185 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0434  hypothetical protein  43.33 
 
 
339 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>